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Client Applications and Server-Side Docker for Management of RNASeq and/or VariantSeq Workflows and Pipelines of the GPRO Suite

2023

The GPRO suite is an in-progress bioinformatic project for -omics data analysis. As part of the continued growth of this project, we introduce a client- and server-side solution for comparative transcriptomics and analysis of variants. The client-side consists of two Java applications called “RNASeq” and “VariantSeq” to manage pipelines and workflows based on the most common command line interface tools for RNA-seq and Variant-seq analysis, respectively. As such, “RNASeq” and “VariantSeq” are coupled with a Linux server infrastructure (named GPRO Server-Side) that hosts all dependencies of each application (scripts, databases, and command line interface software). Implementation of the Serv…

Adaptive synchronization of master-slave systems with mixed neutral and discrete time-delays and nonlinear perturbations

2011

This paper investigates the delay-dependent adaptive synchronization problem of the master and slave structure of linear systems with both constant neutral and time-varying discrete time-delays and nonlinear perturbations based on the Barbalat lemma and matching conditions. An adaption law which includes the master-slave parameters is obtained by using the Lyapunov functional method and inequality techniques to synchronize the master-slave systems without the knowledge of upper bounds of perturbation terms. Particularly, it is shown that the synchronization speed can be controlled by adjusting the update gain of the synchronization signal. A numerical example has been given to show the effe…

La transcripción del lenguaje afásico

2004

En el presente artículo reflexionamos sobre las necesidades que se plantean en la transcripción de un corpus de lenguaje oral procedente de hablantes afásicos; estas reflexiones surgen a propósito de la elaboración del corpus PerLA (Percepción y Lenguaje Afásico).Se revisan los sistemas de trancripción del Análisis conversacional, del proyectos CHILDES y del SALT, señalando sus ventajas e inconvenientes para este tipo de datos.

Dažādu inhalējamo kortikosteroīdu devu pretiekaisuma darbība un kombinētās terapijas efektivitātes salīdzinājums pacientiem ar vidēji smagu persistēj…

2003

Análisis psicológico de las estrategias de autocontrol implicadas en los programas de reducción de daños y riesgos del consumo de heroína

2002

Las intervenciones dirigidas hacia la reducción de daños y riesgos son cada vez más utilizadas en los ámbitos preventivos y de tratamiento de las adicciones a sustancias. Estas estrategias parten de las limitaciones de los modelos tradicionales de abstinencia total al consumo de heroína y otras sustancias, procurando que el sujeto adquiera la capacidad de modificar ciertos comportamientos de riesgo respecto a los parámetros de respuesta de consumo y las conductas asociadas al mismo (autocontrol), a través de la facilitación de una serie de estrategias/herramientas por parte de los centros de tratamiento o de los programas específicos de reducción de daños/riesgos.

Aproximación a la percepción social de las drogas en los colectivos de Enfermería

2004

Las sustancias psicoactivas están bien definidas en la actualidad y tienen unos efectos fisiológicos y psicológicos conocidos. Sin embargo, la percepción y valoración social que se tiene de ellos son independientes de las consecuencias objetivas de ese consu¬mo y de la gravedad de estas. El trabajo que aquí presentamos es una reflexión sobre la necesidad de mejorar la formación que reciben los profesionales (o futuros profesiona¬les) de Enfermería sobre drogodependencias, incluyendo objetivos claramente dirigi¬dos a cambiar sus actitudes y estereotipos. Partimos de los resultados obtenidos en una encuesta pasada a alumnos y profesionales de enfermería de Albacete. Los datos reflejan que est…

Consumo de sustancias psicoactivas, género e identidad psicosocial: análisis de las diferencias intergénero en las actitudes juveniles ante el uso/ab…

2004

Mediante esta aproximación psicosocial al análisis de las actitudes ante el consumo de alcohol y otras sustancias psicoactivas por parte del colectivo juvenil se ofrece una interpretación crítica del llamado problema de la droga y se vincula la revisión actualiza¬da de los motivadores, tendencias y patrones de consumo con la idea relativa a la construcción intersubjetiva de las diferencias inter-género aplicada a tal materia. En esta investigación se le otorga prioridad al objetivo de determinar la existencia de diferen¬cias inter-género en las actitudes juveniles ante el consumo de alcohol en sus tres dimensiones (cognitiva, afectiva y comportamental), así como respecto al nivel de infor¬m…

Actitudes y percepción de riesgo ante el consumo de alcohol en adolescentes: efectos diferenciales respecto a jovenes consumidores de alcohol y cocaí…

2006

La experimentación con alcohol y otras sustancias psicoactivas por parte del colectivo juvenil se vincula a un estilo de ocio recreativo compartido con el grupo de iguales con búsqueda de la sobreestimulación y como mecanismo de reafirmación de la identidad grupal. Desde una aproximación psicosocial como la aportada se propone un análisis de la esfera actitudinal bajo una triple dimensionalidad: factores cognitivos (creencias, expectativas, percepciones, etc.), afectivos (identificación con los usuarios, agrado o desagrado, etc.) y comportamentales (inclinación para la aceptación del hábito). También se explora la percepción de riesgos y la conciencia de daño físico y/o psicosocial derivado…

Actuación de enfermería en el proceso de recuperación de las drogodependencias

2004

Este artículo recoge algunas reflexiones y algunas actuaciones que en la práctica diaria pueden ayudar a establecer una buena relación de ayuda en la recuperación de las drogodependencias.Como sea que para la O.M.S. es muy importante considerar al ser humano como un ser bio-psico-social y fomentar su salud, para favorecer el no consumo de sustancias psicoactivas tenemos que abordar no sólo la abstinencia sino también aquellos aspec¬tos emocionales y de relación a partir del autoconocimiento y de un cambio de estilo de vida.Para facilitar esta recuperación es muy importante como recibimos al paciente por primera vez y nuestra actitud en los sucesivos días.La acogida, la escucha activa, el re…

Sobre el malestar y la prescripción: un estudio sobre los usos de psicofármacos por las mujeres

2003

Los psicofármacos son un grupo de fármacos de elevado consumo en el Sistema Sani¬tario Español, siendo las mujeres las principales usuarias. Presentamos una investiga¬ción cualitativa realizada durante dos años en la cual hemos realizado entrevistas semiestructuradas a profesionales de Atención Primaria y Psiquiatría y grupos de dis¬cusión con mujeres usuarias de estos fármacos en tres Comunidades Autónomas del Estado Español.Nuestros resultados muestran un perfil de usuarios-as que coincide con el descrito en la literatura clínica, señalándose a las mujeres como las principales consumidoras de estos fármacos. A través de los discursos de profesionales sanitarios y mujeres consu¬midoras de …