Search results for "PCR"

Développement et évaluation d'une méthode fondée sur la PCR temps réel pour la caractérisation des bioaérosols : application au groupe des actinomycè…

2013

Actinomycetes are ubiquitous bacteria and some can be potentially pathogen for Humans in the air of some working areas. It’s notably the case in composting plants where bacteria concentrations can reach high values. Workers exposure to these inhalable bioaerosols can be source of various diseases (hypersensitivity pneumonitis notably). Although this problem is admitted, bibliography reveals a lack of knowledge about risk assessment: currently, none global method for bioaerosols sampling and analysis is standardized. So much that neither dose-effects relationship for most of these bacteria, nor Threshold Limit Value exists. Traditional methods, that are used, have some drawbacks (concentrati…

Characterization of rhizobia nodulating chickpea in Tunisia

2001

Cent cinquante rhizobia nodulant le pois chiche (Cicer arietinum L.) ont ete isoles a partir de sols echantillonnes dans differentes regions de Tunisie. L'inoculation de la plante hote avec ces isolats montre une variabilite dans le temps d'apparition des premieres nodosites. Cinq isolats induisent des nodosites deux semaines apres inoculation alors que pour les 145 isolats restants les nodosites ne sont observees qu'apres au moins quatre semaines. L'etude par PCR/RFLP de l'ADNr 16S a permis de rattacher les isolats du premier groupe a l'espece Mesorhizobium mediterraneum et ceux du second groupe a l'espece Sinorhizobium medicae. La position taxonomique des isolats a ete confirmee par leurs…

Localisation et visualisation de transcrits fongiques in situ: Une méthode originale qui combine biologie moléculaire et microscopie confocale

2011

National audience; Les Gloméromycètes, formant la symbiose mycorhizienne à arbuscules, sont des champignons biotrophes obligatoires qui sont intimement associés aux tissus végétaux qu’ils colonisent. Les techniques utilisées pour suivre l’expression des gènes fongiques dans les racines mycorhizées ne permettent pas de définir le profil spatio-temporel de leur activité. Afin de tracer l’activité transcriptionnelle fongique dans les racines mycorhizées, une méthode innovante, basée sur la RT-PCR in situ, a donc été développée. Cette technique permet de localiser, en microscopie optique confocale à balayage laser, des transcrits fongiques, à l’aide d’amorces spécifiques marquées par un fluoroc…

Duplex PCR method for rapid detection of Zymomonas mobilis in cider

2005

Identification de gènes liés à la résistance aux herbicides non liée à la cible chez les Ivraies : vers des tests « moléculaires » de diagnostic

2016

Identification of genes linked to non-target-site resistance to herbicides in ryegrass : towards "molecular" diagnosis assays. Setting up molecular diagnosis tools would greatly foster preventing and managing non-target-sitebased resistance to herbicides (NTSR). This is currently hampered by the complexity of NTSR genetic determinism, which is largely based upon differences in the expression of an unknown number of genes between resistant and sensitive plants. Identifying NTSR genes is thus a challenging task. Herein, we report the identification of 19 genes which expression patterns are correlated to NTSR to ALS-inhibiting herbicides in rye-grasses (Lolium sp.). We demonstrate the potentia…

Étude de la biodégradation de l'herbicide acide 2.4-dichlorophénoxyacétique (2.4-D) dans des sols agricoles de la région de Constantine

2011

Les principaux facteurs conditionnant la biodégradation du 2,4-D dans trois sols agricoles algériens (45IB, 46BM et 47AA), notamment l'humidité et la température, ont été examinés. Les cinétiques de minéralisation de l'herbicide ont été déterminées par radiorespirométrie, qui consiste à piéger et estimer le 14C02 formé dans une solution de soude à l'aide d'un compteur à scintillation liquide. Les résultats obtenus confirment la présence de microorganismes dégradants le 2,4-D et la biodégradation de cet herbicide semble dépendre essentiellement des propriétés physicochimiques intrinsèques des sols notamment la teneur en argile et MgO. Le sol 46BM, caractérisé par de faibles quantités en sabl…

Quantification of denitrifiers by real-time PCR

2007

Comparaison de deux témoins d’inhibition de la PCR diagnostique

2015

National audience

Résistance du coquelicot aux inhibiteurs de l'ALS: La mise au point d'outils de diagnostic rapide a permis de révéler la présence de cette résistance…

2011

National audience; Les inhibiteurs de l'acétolactate-synthase (ALS) sont actuellement la principale famille d'herbicides utilisés en France. La capacité de diagnostiquer rapidement la présence de plantes résistantes dans les parcelles contribue au maintien de leur efficacité. Des tests « ADN » ont été développés chez les coquelicots (Papaver rhoeas, Papaver dubium et Papaver argemone) pour détecter les mutations de l'ALS conférant une résistance à des herbicides. Les tests ont servi à analyser des plantes de coquelicots provenant de parcelles où des échecs de contrôle par des inhibiteurs de l'ALS ont été observés. Ils ont révélé la présence de mutations de l'ALS en fréquences élevées dans 2…

Technosols to reclaim industrial wastelands: depth distribution of abundance and activity of N-cycling microbial communities

2012

International audience; Construction of Technosols through assemblage of treated soil and recycled wastes is an innovative option for the restoration of degraded lands and re-use of industrial wastes. Recent studies have evidenced that Technosols could support soil functions such as primary production but the knowledge about other ecosystemic services, such as nutrient cycling, is limited. In this work, we investigated the abundance and the activity of microbial communities involved in N-cycling in different horizons (0–15, 15–35, 35–70 cm) of two types of Technosols constructed to reclaim an industrial wasteland. The estimation by real-time PCR of the abundances of the different microbial …