Search results for "SELEX"
showing 10 items of 13 documents
Corrosion in alkanolamine used for acid gas removal: From natural gas processing to CO2 capture
2010
The aim of this paper is to review some of the parameters influencing the corrosivity of alkanolamine solvents used for natural gas purification or for CO2 capture. In the light of literature data and of new experimental results, the influences of temperature and of acid gas loading are discussed. These two parameters appear to have a strong impact on corrosion rates of carbon steel, with extrapolated corrosion rates of several tens of mm/year for the highest temperature and acid gas loading condition.
Differential binding cell-SELEX method to identify cell-specific aptamers using high-throughput sequencing
2018
AbstractAptamers have in recent years emerged as a viable alternative to antibodies. High-throughput sequencing (HTS) has revolutionized aptamer research by increasing the number of reads from a few (using Sanger sequencing) to millions (using an HTS approach). Despite the availability and advantages of HTS compared to Sanger sequencing, there are only 50 aptamer HTS sequencing samples available on public databases. HTS data in aptamer research are primarily used to compare sequence enrichment between subsequent selection cycles. This approach does not take full advantage of HTS because the enrichment of sequences during selection can be due to inefficient negative selection when using live…
FRI0265 Selexipag in Raynaud's Phenomenon Secondary To Systemic Sclerosis: A Randomised, Placebo-Controlled, Phase II Study
2016
Background Raynaud9s phenomenon (RP) occurs in >95% of patients (pts) with systemic sclerosis (SSc) and contributes to digital ischaemia that may lead to digital ulcers (DUs) and gangrene.1,2 Empirical treatment of SSc-associated RP includes oral vasodilators, particularly calcium channel blockers and intermittent intravenous prostacyclin analogues.3,4 However, there is a need to identify oral therapies that are more efficacious than those currently available. Objectives To determine the activity of selexipag, an oral, selective, prostacyclin receptor agonist, on RP attack frequency in pts with SSc. Methods The study comprised a placebo single-blind run-in phase of 2–4-weeks followed by an …
Šūnā internalizējošas aptamēra-aptamēra konjugātsistēmas izveide
2020
Aptamēri ir oligonukleotīdi, kas savas trīsdimensionālās formas dēļ spēj saistīties ar specifiskiem mērķiem. Tie tiek plaši pētīti kā palīgs zāļu piegādāšanai vai slimību diagnostikā. Pēdējos gados padziļināti ir pētīta to pielietošana vēža terapijā. Bakalaura darba mērķis bija noskaidrot, aptamēra konstrukta AS1411 un Seq36 afinitāti uz gaišo nieru karcinomas šūnām. Lai pārliecinātos par AS1411 un Seq36 aptamēru konstrukta veiksmīgu izveidošanu, tika pielietota gela elektroforēze. Lai noteiktu cik funkcionāls un cik liela afinitāte ir uz gaišo nieru karcinomas šūnām, tika pielietota plūsmas citometrija. Pētījuma rezultāti liecina, ka aptamēru konstrukts parāda labāku saistīšanos ar gaišo n…
Efficacy and Safety of Selexipag in Adults With Raynaud's Phenomenon Secondary to Systemic Sclerosis:A Randomized, Placebo-Controlled, Phase II Study
2017
Objective To determine the effect of selexipag, an oral, selective IP prostacyclin receptor agonist, on the frequency of attacks of Raynaud's phenomenon (RP) in patients with systemic sclerosis (SSc). Methods Patients with SSc-related RP were randomized 1:1 to placebo (n = 38) or selexipag (n = 36) in individualized doses (maximum of 1,600 μg twice daily) during a 3-week titration period. The primary end point was the weekly average number of RP attacks during the study maintenance period, analyzed using a Bayesian approach with a negative binomial model adjusted for baseline number of RP attacks. Other outcome measures included Raynaud's Condition Score (RCS), RP attack duration, and treat…
The selection of aptamers specific for membrane molecular targets
2010
AbstractA growing number of RNA aptamers have been selected experimentally using the SELEX combinatorial approach, and these aptamers have several advantages over monoclonal protein antibodies or peptides with respect to their applications in medicine and nanobiotechnology. Relatively few successful selections have been reported for membrane molecular targets, in contrast to the situation with non-membrane molecular targets. This review compares the procedures and techniques used in selections against membrane proteins and membrane lipids. In the case of membrane proteins, the selections were performed against soluble protein fragments, detergent-membrane protein mixed micelles, whole cells…
Šūnu - selex atlasīto aptamēra specifiskums in vitro
2020
Aptamēri aizvien vairāk pierāda savas spējas diagnostikā kā arī terapijā. Vēl aizvien daudzām sarežģītām slimībām trūkst terapijas vai diagnostikas līdzekļi, tādēļ aptamēri varētu būt potenciāli terapijas vai diagnostikas līdzekļi. Šajā pētījumā tika pētīti iepriekš atlasīti nieru kanāliņu epitēlija un nieru karcinomas šūnu līniju RC-124 un RCC-MF specifiski aptamēri (seq36), izmantojot attēlveidojošo plūsmas citometrijas metodi. Tika veikts aptamēru selektivitātes skrīnings pret RC-124, RCC-MF, 769-P, MCF-7, MDA-MB-231, THP-1 un HeLa šūnu līnijām. Novērojām visspēcīgāko aptamēra 36seq saistīšanos ar MDA-MB-231 šūnām, tomēr ar MCF-7 saistīšanās netika novērota, tā pat kā ar THP-1 un HeLa šū…
Aptamēru atlase pret urīnpūšļa audzēja mērķproteīnu Nectin–4 raksturīgiem proteīniem
2022
Urīnpūšļa vēzis ir viens no visvairāk diagnosticētajiem vēžiem pasaulē, taču tā diagnostikai un terapijai nepieciešamas jaunas metodes, lai veiksmīgāk atklātu un varētu ārstēt šo slimību. Šo lomu var veikt mērķterapijas zāles, piemēram aptamēri vai antivielas. Šajā darbā veicām aptamēru proteīnu-SELEX atlasi uz urīnpūšļa membrānas paaugstināti ekspresētu proteīnu – nectin-4, uz kuru jau ir izveidotas un klīnikā izmantotas antivielu terapijas zāles. Šajā darbā vēlējāmies, veicot sekvenču bibliotēkas apstrādi, SELEX atlasi un sekvencēšanu, iegūt līdersekvences ar spēju specifiski saistīties uz attīrītu nectin-4 proteīnu. Rezultātā tika iegūtas trīs līdersekvences ar potenciālu kļūt par aptamē…
Specifisku aptamēru atlasīšana izmantojot šūnu - SELEX metodi
2018
Aptamēri pēdējo gadu laikā ir ieguvuši augstāku uzmanību, jo to specifisko saistīšanos pie mērķa var izmantot dažādu slimību diagnostikā un terapijā. Nieru karcinomas ārstēšanas terapijā izmantotie līdzekļi ir toksiski pacientam un nav pietiekami efektīvi. Aizvien vairāk tiek meklētas jaunas pieejas terapijai. Šajā pētījumā izmantojām aptamērus, tos atlasot pret nieru karcinomas šūnām, ar šūnu-SELEX metodi. Pēc 11 atlases cikliem tika veikta aptamēru sekvencēšana, izmantojot otrās paaudzes sekvencēšanu, un iegūto datu analīze. Pēc datu analīzes varēja novērot 15 unikālas aptamēru sekvences, kas specifiski saistās tikai pie RCC-MF šūnām un 4 sekvences, kas saistās ar RC-124 un RCC-MF šūnām, …
Gaišo šūnu nieru karcinomas specifiski aptamēri
2015
Nieru karcinomas skarto pacientu skaits pastāvīgi pieaug un joprojām nav efektīvas mērķētas terapijas, kas darbotos uz nieru karcinomas šūnām. Aptamēri ir oligonukleotīdu molekulas, kas saistās specifiski ar savu molekulāro mērķi to trīsdimensionālās struktūras dēļ un pēdējos gados pierādījuši sevi kā efektīvi mērķētās terapijas līdzekļi. Šūnu SELEX metode, kurā kā mērķis tiek izmantotas šūnas, uzskatāma par vienu daudzsološākajām aptamēru atlases metodēm, ar kuru identificēt terapeitiskos aptamērus. Darba rezultātā ir izstrādāts pētījuma protokols, ar kuru iespējams veikt specifisku aptamēru atlasi pret nieru karcinomas šūnām (RCC-MF), kā arī piesaistīti nepieciešamie finansiālie līdzekļi …