Search results for "TAXONOMIE"
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Soft Topographic Map for Clustering and Classification of Bacteria
2007
In this work a new method for clustering and building a topographic representation of a bacteria taxonomy is presented. The method is based on the analysis of stable parts of the genome, the so-called “housekeeping genes”. The proposed method generates topographic maps of the bacteria taxonomy, where relations among different type strains can be visually inspected and verified. Two well known DNA alignement algorithms are applied to the genomic sequences. Topographic maps are optimized to represent the similarity among the sequences according to their evolutionary distances. The experimental analysis is carried out on 147 type strains of the Gammaprotebacteria class by means of the 16S rRNA…
La contribution d’EURO+MED–PESI à la liste des plantes vasculaires de l’Afrique du Nord
2010
Biological nitrogen fixation for the 21st century
1998
The biodiversity of nitrogen-fixing organisms is huge. Taxonomic and phylogenetic research is needed to structure this diversity, to facilitate communication among scientists, and to increase our understanding of the evolution and biology of diazotrophs. Molecular tools for taxonomic and biodiversity studies of diazotrophic rhizobia, frankiae, cyanobacteria and bacilli are presented in sections 2 to 5. Sections 6 to 9 focus on problems with genus and species assignment.
Evaluation agroécologique de systèmes de culture en zone tropicale humide : Cas de la mise en valeur agricole d'une savane herbacée acide (Plaine des…
2013
Dans les régions tropicales humides, concilier intensification agricole et protection des ressources naturelles est un défi majeur et difficile à relever. Dans les savanes acides du nord-est laotien, des systèmes de culture de semis direct sur couverture végétale (SCV), basés sur les trois principes du non-labour, d’une couverture permanente du sol, et sur la pratique de rotations culturales diversifiées, sont proposés comme alternative technique à l’intensification agricole conventionnelle basée sur le labour. Si ces systèmes ont connu une diffusion importante et rapide dans les grandes agricultures mécanisées, leur diffusion reste néanmoins à ce jour limitée en contexte de petite agricult…
Contribution of molecular biology techniques to the knowledge of soil microbial diversity and functions
2012
Depuis le développement de l’industrialisation, de l’urbanisation et de l’agriculture intensive, le sol est de plus en plus soumis à de nombreuses variations des conditions environnementales entraînant des modifications de la diversité taxonomique et de la fonctionnalité des communautés microbiennes indigènes. Par conséquent, la question de la signification fonctionnelle de ces pertes/modifications de biodiversité en termes de capacité des écosystèmes à maintenir les fonctions et services dont l’humanité dépend est aujourd’hui centrale. Dans ce contexte, un des challenges en écologie microbienne est de mieux définir et comprendre les processus qui génèrent et maintiennent la diversité micro…
Mise en place d'une base de données d'assignation taxonomique dédiée au logiciel GnS-PIPE et automatisation de sa mise à jour
2013
Rapport de stage de fin d'études de DUT, Spécialité Génie Biologique option Bio-Informatique EA GenoSol CT?; DEUG; Dans un contexte où l'agriculture doit pouvoir produire toujours plus pour faire face à la croissance mondiale tout en étant respectueuse de l'environnement, l'agroécologie apparaît comme un domaine d'étude déterminant. Dans ce domaine, la plateforme GénoSol s'est fixé comme objectif de caractériser les microorganismes des sols agricoles en utilisant les techniques de séquençage à haut-débit. Possédant son propre pipeline d'analyse, GénoSol s'est intéressé à l'ajout de bases de données d'ADNr 16S pour l'étape d'assignation taxonomique, afin d'augmenter la fiabilité des résultat…
A trait-based analysis of cover crop strategies for resource acquisition and use: application to weed control in banana cropping systems
2014
International audience
EMbaRC designing training and e-learning materials for biological resource centres
2012
International audience; The European Consortium of Microbial Resource Centres (EMbaRC, www.embarc.eu) is a research infrastructure project gathering together the major microbial Biological Resource Centres (BRCs) in Europe. These cultures collections have a long and respected tradition in training people that are involved in microbial taxonomy, preservation and management. Advanced and bespoke courses on related topics add high value to the European educational community and create a knowledge-based training network. Under the framework of EMbaRC, the training programmes offered by the consortium were surveyed and schemes were proposed to establish an educational community to create a knowl…
Utilisation de systèmes à base de folksonomies dans un processus de veille : propositions pour l'organisation et l'exploitation des informations coll…
2009
L'utilisation de folksonomies dans le cadre d'un processus de veille est un phénomène qui peu à peu est intégré aux pratiques de la veille sur l'Internet. Les folksonomies lorsqu'elles sont considérées comme sources d'information présentent un grand intérêt dans la mesure où elles permettent d'identifier et de surveiller l'émergence de nouveaux concepts ainsi que leurs représentations. Leur dimension collaborative et sociale facilite l'identification de cibles et d'experts. La diversité des ressources décrites au moyen de folksonomies permet d'élargir le champ des recherches d'information à des domaines parfois mal couverts par les outils plus traditionnels que sont les moteurs de recherche…
A quoi sert l'audit environnemental ?
2013
International audience; L'objectif de cet article est de comprendre le rôle de l'audit dans le domaine environnemental afin d'en proposer une taxonomie. A partir d'une grille d'analyse découlant des théories néo-institutionnelle et des parties prenantes, cette taxonomie est obtenue en étudiant les pratiques d'audit d'une entreprise française proactive en matière environnementale. Les résultats montrent qu'en l'absence de réglementation en matière de vérifications environnementales, l'audit peut remplir plusieurs rôles dans ce domaine : vérification de la conformité réglementaire, identification des aspects environnementaux d'un site industriel, analyse de cycle de vie d'un produit, vérifica…