Search results for "avidiini"

The avidin protein family : properties of family members and engineering of novel biotin-binding protein tools

2005

Eliöiden perimä sisältää kullekin lajille tyypillisen geneettisen tiedon ja määrittelee niiden ominaisuuksia. Lajien perimän yksityiskohtainen tarkastelu ja vertailu selvittää lajien ominaisuuksien perustaa. Suuri osa perimän sisältämistä geeneistä koodaa proteiineja, jotka ovat keskeisiä solujen rakenteille ja toiminnoille.Vesa Hytönen tarkasteli väitöskirjassaan kanan avidiini-proteiinin ja samaan geeniperheeseen kuuluvien avidiinin kaltaisten geenien (AVR) koodaamien AVR-proteiinien tuottamista ja ominaisuuksia. Avidiinin tehtävä on sitoa vesiliukoista H-vitamiinia, jota kutsutaan myös biotiiniksi. Avidiinia esiintyy erityisesti kananmunan valkuaisessa, jossa sen arvellaan toimivan puolu…

Uuden bakteeriperäisen avidiinin sukulaisproteiinin tuottaminen, puhdistus sekä sen ominaisuuksien määrittäminen

2007

Bifunktionaalisten reagenssien synteesi, ominaisuudet ja sovellukset

2006

Bradavidiinista johdetun bradpeptidin karakterisointi ja soveltuvuus affiniteettikromatografiaan

2012

Bradavidiini on Bradyrhizobium japonicum bakteerista löydetty avidiinin ja streptaviidiinin kaltainen proteiini. Avidiini on peräisin kanasta ja streptavidiini Streptomyces avidinii bakteerista. Bradavidiinin aminohapposekvenssi on noin 30 prosenttisesti samankaltainen avidiinin ja streptavidiinin ydinalueiden sekvenssien kanssa. Bradavidiini koostuu 138 aminohaposta ja C-terminaalisesti pienennetty bradavidiini, ns. bradcore, 118 aminohaposta. Bradavidiinilla on useimpien avidiinien tapaan tetrameerinen kvaternaarirakenne ja se muistuttaa sekä rakenteeltaan että toiminnaltaan avidiinia ja streptavidiinia. Bradavidiinilla on muiden avidiinien tapaan kyky sitoa voimakkaasti D-biotiinia. Avid…

Engineering of charge, biotin-binding and oligomerization of avidin : new tools for avidin-biotin technology

2002

Avidin is a tetrameric glycoprotein found in chicken egg white. Due to its remarkably high affinity for biotin, avidin has widely been used in biological and biotechnical applications in life sciences. Avidin is also a highly stable protein, maintaining its functional tetrameric structure at high temperatures, extremes of pH, and in the presence of strong denaturants. In the present study we wanted to find out whether different properties of avidin can be modified with protein engineering using rational design. We used the 3D-structure of avidin together with sequence information from various avidin-like proteins to plan these changes. Besides shedding more light on the protein chemical bas…

Strongavidiini - biotiinia sitova merisiilestä peräisin oleva avidiinin kaltainen proteiini

2009

Biotiinia eli vitamiinia H suurimmalla luonnossa tavatulla ei-kovalenttisella affiniteetilla sitovaa avidiinia ja sen bakteeriperäistä sukulaisproteiinia streptavidiini käytetään laajasti erilaisissa avidiini-biotiini teknologian sovellutuksissa. Alun perin avidiini löydettiin kananmunan valkuaisesta ja sen rakenne on myöhemmin selvitetty tarkasti. Avidiinilla ja streptavidiinilla on monia hyödyllisiä ominaisuuksia. Avidiinin ja streptavidiinin on havaittu biotiiniin sitouduttuaan olevan erittäin stabiileja proteiineja, jotka kestävät hyvin mm. proteolyyttisiä entsyymejä ja ne omaavat voimakkaan lämmönkestävyyden. Yksi avidiini koostuu neljästä samanlaisesta monomeeristä, joista jokainen py…

Internalization of novel non-viral vector TAT-streptavidin into human cells

2007

BMC Biotechnology, 7 (1)

Avidin engineering : modification of function, oligomerization, stability and structure topology

2003

Avidiini on neljästä samanlaisesta alayksiköstä muodostunut tetrameerinen glykoproteiini, jota esiintyy luontaisesti, pieninä pitoisuuksina, kanan munanvalkuaisessa. Eräs avidiinin merkittävimmistä ominaisuuksista on sen kyky sitoa vitamiini biotiinia. Avidiinin ja biotiinin välinen vuorovaikutus on voimakkain tunnettu luonnossa esiintyvä ei-kovalenttinen sidos proteiinin ja sen ligandin välillä. Tätä ominaisuutta on hyödynnetty jo pitkään lukuisissa bio- ja lääketieteellisissä sovelluksissa, jotka yhdessä muodostavat niin kutsutun (strept)avidiini-biotiini -teknologian. Avidin is a basic and rather stable tetrameric glycoprotein found in chicken egg-white. It has an enormous affinity towar…

Intracellular delivery of baculovirus and streptavidin-based vectors in vitro : towards novel therapeutic applications

2008

Geeniterapia on kokeellinen lääketieteellinen hoitomuoto, jonka pyrkimyksenä on korvata solujen perintöaineksen puuttuva tai vaurioitunut geeni ja sen tuote. Toistaiseksi geeniterapian kliiniset kokeet ovat kohdistuneet pääasiassa syövän, sydän- ja verisuonisairauksien ja yksittäisten geenivirheiden aiheuttamien sairauksien hoitoon.Geenien kuljettamiseen soluihin, kudoksiin tai elimiin käytetään joko synteettisiä tai virusperäisiä kuljettimia. Kuljettimien kehittämisessä kuhunkin tautimalliin sopivaksi on kuitenkin vielä monia haasteita, kuten syntyvät immuniteettireaktiot sekä hoitogeenin ilmentymisen riittävä tehokkuus kohdekudoksessa. Johanna Laakkonen seurasi väitöstutkimuksessaan lupaa…

Avidiini-HABA-kompleksin karakterisointi ja kontrollointi

2011

Avidiini on tetrameerinen proteiini, jota on tutkittu ja käytetty paljon ligandien sitomiskykynsä ansiosta. Avidiinin luonnollinen ligandi on biotiini, jonka affiniteetti avidiiniin on erittäin voimakas (Kd=10-15 M). Avidiini kykenee sitomaan myös muita ligandeja, mutta pienemmällä affiniteetilla. Yksi avidiiniin sitoutuvista molekyyleistä on HABA (4’-hydroksiatsobentseeni-2-karboksyylihappo) -atsoväri, jota on käytetty avidiini-biotiiniteknologiassa hyväksi. HABA-molekyylillä on kaksi eri rakenteellista isomeerimuotoa, trans- ja cis-isomeerit. Yleensä se esiintyy tasomaisena molekyylinä eli trans-isomeerina, mutta se voi menettää tasomaisen rakenteensa ja ilmentyä tällöin cis-isomeerinä. A…