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Biodiversité fongique du raisin au vin : impact de l'activité anthropique

2016

The effects of different anthropogenic activities (vineyard, winery) on fungal populations from grape to wine were studied. To characterize these effects, it was necessary to access to the overall diversity of populations (pyrosequencing and spectroscopy FT-IR) but also to intra-specific diversity (FT-IR). Spectroscopy FT-IR has been validated for their ability to characterize the global population and to discriminate the strains for three species of non-Saccharomyces yeasts (NS). For the first time, it is shown that the grape berry is a limited source for NS yeasts while the winery seems to be a significant source; the air is an important vector for dissemination of these yeasts. In additi…

Microbial diversity and structure are drivers of the biological barrier effect against Listeria monocytogenes in soil

2013

International audience; Understanding the ecology of pathogenic organisms is important in order to monitor their transmission in the environment and the related health hazards. We investigated the relationship between soil microbial diversity and the barrier effect against Listeria monocytogenes invasion. By using a dilution-to-extinction approach, we analysed the consequence of eroding microbial diversity on L. monocytogenes population dynamics under standardised conditions of abiotic parameters and microbial abundance in soil microcosms. We demonstrated that highly diverse soil microbial communities act as a biological barrier against L. monocytogenes invasion and that phylogenetic compos…

Transition to conservation agriculture : changes in cropping practices and responses of weed communities

2020

Conservation agriculture is a farming system based on the continuous and simultaneous application of three principles: minimal soil disturbance, continuous residue cover on the soil surface and diverse crop rotations. Adoption of this form of sustainable agriculture in France since the 2000s has been hampered by a number of constraints, including the development and management of weed populations. From an agronomic point of view, the adoption of conservation agriculture and associated abandonment of tillage results in a significant loss of weed management practices for farmers. From an ecological point of view, its application can modify all the assembly processes that act on weed communiti…

Réalisation d'une analyse de risques relative au houblon du Japon et élaboration de recommandations de gestion

2018

Réalisation d'une analyse de risques relative au houblon du Japon et élaboration de recommandations de gestion

N-cycling: Bridging microbial community ecology and terrestrial ecosystem functioning

2013

Communication orale invitée, résuméEAEcolDur; Microbial communities have a central role in ecosystem processes by driving the Earth's biogeochemical cycles.

Les mousses des champs : quels effets sur les cultures ?

2021

Le développement de bryophytes dans les systèmes cultivés,notamment ceux limitant très fortement le travail du sol, pose la question de leur impact sur les cultures et la écessité ou non de les contrôler.CONTEXTE - Les bryophytes sont largement présentes dans les milieux occupés parl’homme. Comme pour beaucoup de communautés se développant dans de tels environnements (espèces adventices, insectes, etc.),leur présence peut être perçue positivementou négativement en fonction de la gêne, fondéeou infondée, qu’elle provoque.ÉTUDE - Cet article a pour objectif de mieuxconnaître cette composante de l’agroécosystème et de comprendre comment elle fonctionne et quelles sont ses interactions potentie…

Optimisation de la procédure d'extraction d'ADN des sols pour caractériser la diversité microbienne tellurique par le pyroséquençage des gènes riboso…

2013

Depuis plusieurs années, les communautés microbiennes du sol (bactériennes et fongiques) sont étudiées au travers de leur ADN. Le mode d’extraction de l’ADN du sol revêt donc une importance capitale pour décrire la biodiversité microbienne. A ce jour, de nombreuses procédures d’extraction d’ADN (commerciales ou non) des sols sont disponibles et utilisées. Il est cependant difficile de comparer les résultats d’études ayant utilisés différents protocoles d’extraction. L’emploi d’une méthode d’extraction standardisée est donc devenu indispensable pour comparer les résultats de différents laboratoires, comme la norme “ISO-11063: Soil quality – Method to directly extract DNA from soil” développé…

Maîtrise et gestion de la biodiversité dans les sols: quelles perspectives ?

2012

National audience

Contribution à l'élaboration de biodescripteurs microbiens pour l'évaluation de l'état biologique et la compréhension du fonctionnement du sol

2013

La biodiversité des sols au service d'une production agricole et d'une société durable

2019

Les sols sont à la base de nombreux services indispensables pour le développement et l’avenir de notre société. Ils sont le principal support de nos constructions et de notre production alimentaire et représentent aussi un puit de carbone capable de participer à la mitigation des changements climatiques. Leur surexploitation agricole, urbaine et industrielle, depuis le début du XXème siècle, a mené à une dégradation importante de leur qualité et donc des services associés. Historiquement, les géologues, les pédologues et les agronomes ont développé une expertise et des capacités de diagnostic de la qualité physique et chimique des sols et confirment l’impact négatif de certaines pratiques d…