Search results for "bioinformatique"
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Approches bioinformatiques innovantes pour l’analyse de données de séquençage à haut-débit appliquées à l’étude de pathologies génétiques rares avec …
2020
In the last years, the advent of exome sequencing (ES) in diagnosis and in research led to the identification of the genetic bases of many Mendelian disorders, allowing many diagnostic wavering cases to be solved. Nevertheless, ES data analysis only leads to the identification of pathogenic or likely pathogenic variants in 30 to 45 % of the undiagnosed cases. Indeed, some limits exist, both at clinical, molecular and bioinformatic levels. The constant evolution of the clinical knowledge, of the number of genes involved in human diseases, and of the clinical-biological correlations, has a significant impact on data analysis, leading to a progressive improvement in diagnostic research. Limits…
Mise en place d'une base de données d'assignation taxonomique dédiée au logiciel GnS-PIPE et automatisation de sa mise à jour
2013
Rapport de stage de fin d'études de DUT, Spécialité Génie Biologique option Bio-Informatique EA GenoSol CT?; DEUG; Dans un contexte où l'agriculture doit pouvoir produire toujours plus pour faire face à la croissance mondiale tout en étant respectueuse de l'environnement, l'agroécologie apparaît comme un domaine d'étude déterminant. Dans ce domaine, la plateforme GénoSol s'est fixé comme objectif de caractériser les microorganismes des sols agricoles en utilisant les techniques de séquençage à haut-débit. Possédant son propre pipeline d'analyse, GénoSol s'est intéressé à l'ajout de bases de données d'ADNr 16S pour l'étape d'assignation taxonomique, afin d'augmenter la fiabilité des résultat…
How to design an efficient and robust pipeline for 16S rRNA-gene sequence analysis to improve our understanding on microbial communities?
2015
Voici la composition du Comité d'Organisation (CO) de JOBIM 2015 Le Comité Logistique (CL) est présidé par : Philippe LEROY (UMR 1095 INRA/UBP, Unité Génétique, Diversité et Ecophysiologie des Céréales - GDEC, Clermont-Ferrand) Eric PEYRETAILLADE (Université d'Auvergne, Unité EA-CIDAM, Clermont-Ferrand) Trois personnes clefs: Secrétariat JOBIM2015 - Manon MARTINET (LB2MN-EA.CIDAM 4678, Université d'Auvergne) Gestion Administrative - Cathy RESSOT (Direction de la Recherche de l’Innovation et de la valorisation, Université d'Auvergne) Gestion Financière - Isabelle DELPIT (Direction de la Recherche de l’Innovation et de la valorisation, Université d'Auvergne) Le Comité Scientifique (CS) est pr…