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Atlas Français des bactéries du sol

2018

Battle Karimi est post-doctorante dans l’UMR Agroécologie à l’INRA de Dijon et s’intéresse à l’écologie des communautés microbiennes. Elle a intégré l’équipe de recherche Biocom en 2016 afin d’analyser l’ensemble des données environnementales et microbiologiques issues du RMQS (Réseau de Mesures de la Qualité des Sols) et de les valoriser sous la forme du présent ouvrage. Elle a participé à la rédaction et à la mise en forme de la majeure partie de l’atlas, et a coordonné son avancement au sein de l’équipe d’auteurs.Nicolas Chemidlin-Prévost Bouré est maître de conférences en biologie des sols à AgroSup Dijon et membre de l’UMR Agroécologie. Spécialisé en écologie des communautés microbienn…

[SDV] Life Sciences [q-bio][SDE] Environmental SciencesSolMicrobiologie du sol[SDV]Life Sciences [q-bio][SDE]Environmental SciencesBactérie du sol[SDV.BV]Life Sciences [q-bio]/Vegetal BiologyCommunauté bacterienne[SDV.BV] Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology[SDV.SA.SDS]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences/Soil study[SDV.SA.SDS] Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences/Soil study
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Connaissance des communautés végétales - Diversité et paysage

2008

National audience

[SDV] Life Sciences [q-bio][SDE] Environmental Sciences[SDV]Life Sciences [q-bio][SDE]Environmental Sciences[SDV.BV]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology[SDV.BV] Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biologypaysagecommunauté végétaleComputingMilieux_MISCELLANEOUSdiversité
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Diversité et activités microbiennes dans la rhizosphère: des atouts majeurs en agroécologie

2012

National audience; Les rhizodépôts libérés par les plantes stimulent une microflore abondante et active dans la rhizosphère. La diversité des communautés microbiennes correspondantes est influencée par la nature des rhizodépôts (composition, molécules signal) qui diffère selon les génotypes végétaux. Le coût pour la plante correspondant à la libération de ces rhizodépôts est contrebalancé par le bénéfice issu des effets positifs de certaines populations microbiennes rhizosphériques sur la croissance et la santé de la plante-hôte. La connaissance des traits végétaux impliqués dans la sélection de ces populations bénéfiques, au sein des communautés microbiennes telluriques, représente un enje…

[SDV] Life Sciences [q-bio][SDE] Environmental Sciences[SDV]Life Sciences [q-bio][SDE]Environmental Sciencesagroécologierhizodépotsselection communautés microbiennes[SDV.BV]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology[SDV.BV] Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biologyenvironnement biotique du solrhizosphèreréduction d'intrants
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Effets des interactions entre diversité végétale inter et intraspécifique et communautés microbiennes du sol sur les propriétés de l’écosystème - Can…

2019

National audience; Le lien entre diversité et fonctionnement d’un écosystème ainsi que les mécanismes sous-jacents sont très étudiés en génétique des populations et en écologie des communautés et des écosystèmes. La première s’attèle à décrire les effets de la variabilité génétique intraspécifique sur différentes propriétés écosystémiques tandis que la deuxième s’intéresse aux interactions écologiques au niveau interspécifique. Notre objectif est de faire le lien entre ces deux champs disciplinaires par l’étude des effets conjoints d’une mobilisation de la diversité végétale intra et interspécifique et de la diversité microbienne sur les propriétés de l’écosystème. Nous avons mesuré différe…

[SDV] Life Sciences [q-bio][SDE] Environmental Sciences[SDV]Life Sciences [q-bio][SDE]Environmental Sciencesazote minéral du solcommunautés microbiennes[SDV.BV]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology[SDV.BV] Life Sciences [q-bio]/Vegetal BiologyDiversité;productivité primaireinteractions plantesmicroorganismesproductivité primaire
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Caractérisation des communautés microbiennes des sols par des approches moléculaires - application au projet "Tahiti - relations multitrophiques"

2014

EA SPE GenoSol; DEUG

[SDV] Life Sciences [q-bio][SDE] Environmental Sciences[SDV]Life Sciences [q-bio][SDE]Environmental Sciencescommunautés microbiennes[SDV.BV]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biologysols de Tahiti[SDV.BV] Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biologyrelations multitrophiques
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Caractérisation par stéréovision de l'hétérogénéité d'un peuplement adventice dans une culture

2007

National audience

[SDV] Life Sciences [q-bio][SDE] Environmental Sciences[SDV]Life Sciences [q-bio]reduction pesticides[SDE]Environmental Sciencescommunauté adventicespeuplement adventicesmodelisation de peuplementComputingMilieux_MISCELLANEOUS
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Colonisation des paysages agricoles par les espèces des bordures adjacentes : apports de l’approche fonctionnelle

2014

National audience; Une crainte avancée par les agriculteurs repose sur l’hypothèse qu’une gestion plus raisonnée des bordures adjacentes aux champs cultivés pourrait, par relâchement de la pression de fauche, favoriser l’entrée de nouvelles espèces, bisannuelles ou pérennes, dans les parcelles agricoles. Afin de répondre à cette interrogation, notre objectif a été de proposer un cadre conceptuel théorique associant plusieurs champs disciplinaires de l’écologie. En comparaison des études précédemment réalisées, notre apport réside en la prise en compte des traits fonctionnels favorisant la dispersion à courte et longue distance, ainsi que des traits expliquant le maintien de populations viab…

[SDV] Life Sciences [q-bio][SDE] Environmental Sciencesassemblage des communautés[SDV]Life Sciences [q-bio]dispersion;traits fonctionnels[SDE]Environmental Sciences[SDV.BV]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biologyécologie des métapopulations[SDV.BV] Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biologyfiltres
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Optimisation du pyroséquençage haut-débit pour caractériser la diversité taxonomique des communautés bactériennes des sols

2011

Affiche, résumé; International audience; La diversité microbienne d’un sol (que l’on estime entre 100 000 et 1 000 000 d’espèces différentes par gramme de sol) est difficile à caractériser. Toutefois, d’importantes avancées en biologie moléculaire, comme le développement du pyroséquençage, ont permis d'obtenir plusieurs centaines de milliers de séquences à partir d’un ADN méta-génomique. Ces nouveaux développements permettent maintenant de caractériser la diversité des communautés microbiennes du sol en se basant sur un marqueur phylogénétique comme l'ADNr 16S, aussi appelée MetaTaxogénomique (Maron et coll., 2011). Toutefois, dans un contexte ou l’écologie microbienne du sol commence à s’a…

[SDV] Life Sciences [q-bio][SDE] Environmental Sciencesbactériediversité taxonomiquesol[SDV]Life Sciences [q-bio][SDE]Environmental Sciencespyroséquençagecommunauté bactérienne
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Comparaison de l'arisa et du séquençage haut débit pour l'étude des processus de diversification des communautés microbiennes du sol

2013

EA SPE EcolDur GenoSol; National audience

[SDV] Life Sciences [q-bio][SDE] Environmental Sciencescommunauté microbienneprocessus de diversification[SDV]Life Sciences [q-bio]relation aire espèce[SDE]Environmental Sciencessélection[SDV.BV]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology[SDV.BV] Life Sciences [q-bio]/Vegetal BiologydispersionComputingMilieux_MISCELLANEOUS
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Dynamique, diversité et adaptation des communautés microbiennes du sol en réponse à différents types de perturbations environnementales : influence d…

2009

[SDV] Life Sciences [q-bio][SDE] Environmental Sciencescommunauté telluriquehdrsol réservoir
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