Search results for "informatique"

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Etudes d'objets combinatoires : applications à la bio-informatique

2011

This thesis considers classes of combinatorial objects that model data in bioinformatics. We have studied two methods of mutation of genes within the genome : duplication and inversion. At first,we study the problem of the whole mirror duplication-random lossmodel in terms of pattern avoiding permutations. We prove that the class of permutations obtained with this method after p duplications from the identity is the class of permutations avoiding alternating permutations of length 2p + 1.We also enumerate the number of duplications that are necessary and sufficient to obtain any permutation of length n from the identity. We also suggest two efficient algorithms to reconstruct two different …

[SDV.SA]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciencesCompositions d’entiers[ INFO.INFO-MO ] Computer Science [cs]/Modeling and Simulation[SDV.SA] Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciencesBioinformaticsDuplicationcompositions d'entiersCompositions of integersInversionDuplicationsPermutationsInversionsGray codes[INFO.INFO-MO]Computer Science [cs]/Modeling and SimulationCodes de Gray[ INFO.INFO-CY ] Computer Science [cs]/Computers and Society [cs.CY][INFO.INFO-CY] Computer Science [cs]/Computers and Society [cs.CY][INFO.INFO-CY]Computer Science [cs]/Computers and Society [cs.CY]CombinatoricsBio-informatiqueCombinatoire[INFO.INFO-MO] Computer Science [cs]/Modeling and Simulation[ SDV.SA ] Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences
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Mise en place d'une base de données d'assignation taxonomique dédiée au logiciel GnS-PIPE et automatisation de sa mise à jour

2013

Rapport de stage de fin d'études de DUT, Spécialité Génie Biologique option Bio-Informatique EA GenoSol CT?; DEUG; Dans un contexte où l'agriculture doit pouvoir produire toujours plus pour faire face à la croissance mondiale tout en étant respectueuse de l'environnement, l'agroécologie apparaît comme un domaine d'étude déterminant. Dans ce domaine, la plateforme GénoSol s'est fixé comme objectif de caractériser les microorganismes des sols agricoles en utilisant les techniques de séquençage à haut-débit. Possédant son propre pipeline d'analyse, GénoSol s'est intéressé à l'ajout de bases de données d'ADNr 16S pour l'étape d'assignation taxonomique, afin d'augmenter la fiabilité des résultat…

[SDV] Life Sciences [q-bio]EzTaxonbase de donnéestaxonomie[SDV]Life Sciences [q-bio]Silvasequençage massifbioinformatique
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Conduite d'une installation pilote de fermentation avec Delphi

1996

National audience

[SDV] Life Sciences [q-bio]INFORMATIQUE[SDV]Life Sciences [q-bio]CONTROLEComputingMilieux_MISCELLANEOUS
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Surveillance de procédé de fermentation en utilisant le courrier électronique

1998

National audience

[SDV] Life Sciences [q-bio]INFORMATIQUE[SDV]Life Sciences [q-bio]ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
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GPA ou STATIS, consensus ou compromis ?

1992

International audience

[SDV] Life Sciences [q-bio]INFORMATIQUE[SDV]Life Sciences [q-bio]ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
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Contribution des systemes experts a la conduite et a l'optimisation d'un procede de fermentation alcoolique

1993

138 ref. Diplôme : Dr. d'Université

[SDV] Life Sciences [q-bio]INFORMATIQUE[SDV]Life Sciences [q-bio]these
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Apport des nouvelles générations de séquençage pour accéder à la diversité des communautés microbiennes du sol : nécessité d’un ‘pipeline’ bio-inform…

2012

National audience

[SDV] Life Sciences [q-bio][SDE] Environmental Sciences16Ssol[SDV]Life Sciences [q-bio][SDE]Environmental Sciencescommunautés microbiennes[SDV.BV]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology[SDV.BV] Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biologypipeline bio-informatiqueComputingMilieux_MISCELLANEOUSpyroséquençagediversité
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Apport des nouvelles générations de séquençage pour accéder à la diversité des communautés microbiennes du sol : nécessité d’un ‘pipeline’ bio-inform…

2011

Communication orale, résuméCommunication orale, résumé; La diversité microbienne d’un sol est difficile à caractériser. Ceci s’explique par une accessibilité plus ou moins importante des populations au sein d’une matrice hétérogène et structurée, mais aussi par l’incapacité à résoudre une information constituée de 100 000 à 1 000 000 d’espèces différentes par gramme de sol. Toutefois, récemment, d’importantes avancées en biologie moléculaire ont permis de mieux caractériser la diversité des communautés microbiennes du sol in situ et ce sans a priori. Ainsi, la puissance des nouvelles générations de séquençage comme le pyroséquençage permettent de travailler en haut-débit afin d’obtenir plus…

[SDV] Life Sciences [q-bio]méta-génomique monogénique;bio-informatique;pyroséquençage;pipeline[ SDV ] Life Sciences [q-bio]bio-informatique[SDV]Life Sciences [q-bio]pipelineméta-génomique monogéniquepyroséquençage
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Détermination des biais liés à la saisie des données et aux différences individuelles dans la lecture des paysages

1978

International audience

[SHS.ANTHRO-SE] Humanities and Social Sciences/Social Anthropology and ethnology[ SHS.ANTHRO-SE ] Humanities and Social Sciences/Social Anthropology and ethnologyinformatiquelectures des paysagessaisie des données[SHS.ANTHRO-SE]Humanities and Social Sciences/Social Anthropology and ethnologyComputingMilieux_MISCELLANEOUS
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Micro-informatique et procédures conversationnelles des données. Le logiciel Anaconda

1982

International audience

[SHS.ANTHRO-SE] Humanities and Social Sciences/Social Anthropology and ethnologyprocédures conversationnelles[ SHS.ANTHRO-SE ] Humanities and Social Sciences/Social Anthropology and ethnologyMicro-informatiquelogiciel[SHS.ANTHRO-SE]Humanities and Social Sciences/Social Anthropology and ethnologyAnacondadonnéesComputingMilieux_MISCELLANEOUS
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