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Evolution de la résistance aux herbicides chez l’Ambroisie (Ambrosia artemisiifolia) : recherche des déterminismes génétiques et application au diagn…

2019

National audience; Ce projet de thèse considère une plante adventice particulièrement problématique : l’Ambroisie à feuilles d’armoise (Ambrosia artemisiifolia), une espèce impactant à la fois la production agricole et la santé publique (pollen très allergisant et allergénique). Les inhibiteurs de l’acétolactate synthase (ALS), une famille d’herbicides, représentent aujourd’hui le levier le plus efficace pour le contrôle de cette adventice dans les parcelles agricoles. Cependant, des résistances à ces herbicides ont été identifiées chez l’Ambroisie, entrainant des échecs de traitements. Les données disponibles montrent la présence de résistance liée à la cible (mutations structurales de l’A…

Contribution à l'élaboration de biodescripteurs microbiens pour l'évaluation de l'état biologique et la compréhension du fonctionnement du sol

2013

Crustacés amphipodes de surface (Gammares d'eau douce)

2012

EA MERS CT3; National audience; L’ouvrage de Piscart & Bollache présente une clef de détermination actualisée des amphipodes de surface de la France métropolitaine. Les espèces natives et invasives sont décrites, avec une carte de la répartition de chaque espèce. L’ouvrage est agrémenté d’une partie décrivant l’écologie des amphipodes, leur comportement et leurs pathogènes les plus fréquemment rencontrés.

Characterisation of rye-grass (Lolium sp.) transcriptome-wide response to ALS-inhibiting herbicides

2014

International audience; Non-target-site-resistance (NTSR) to herbicides is a major cause for failure in the chemical control of a number of weeds, and is especially widespread and important in grass weeds. Although several gene families have been shown to be involved in NTSR (cytochromes p450, glutathione-S-transferases, glycosyl-transferases, ABC transporters, esterases…), the genetic determinants of NTSR are still poorly known to date. NTSR is part of the response of weeds to herbicides. To unravel NTSR, it is thus of interest to firstly characterise the processes involved in herbicide stress response in grasses. For this purpose, we implemented a comparative whole-transcriptome sequencin…

Identification de mécanismes de résistance non liée à la cible grâce à la transcriptomique

2013

We have witnessed a dramatic increase in the number of weeds showing herbicide resistance during the past three decades. The potentially most dangerous mechanisms of resistance endows Non-Target-Site based Resistance (NTSR): NTSR is polygenic, unpredictable and can confer cross-resistance to herbicides with different modes of action. High throughput sequencing methods, like RNA sequencing (RNA-seq), are particularly effective to identify genes differentially expressed between two experimental modalities. Therefore, RNA sequencing was implemented to identify genes involved in NTSR to clodinafop (an ACCase inhibitor) in black-grass. Black-grass transcriptome was sequenced from 4 sensitive pla…

Un facteur de transcription impliqué dans le développement de la graine chez Medicago truncatula

2013

Population genetics on Ambrosia genus: past, present and future

2014

National audience; A new Task Force within the COST-SMARTER has recently been created. This group is composed of population genetics experts from five European countries in charge of focusing on “Genetics on Ambrosia” (Austria, France, Germany, Hungary, Sweden). Their mission was to review molecular methods used in published genetics studies on common ragweed and to discuss about future projects. Two different types of molecular markers are generally used in the literature to investigate the genetic structure within and between introduced and/or native populations of common ragweed: microsatellite markers and amplified fragment length polymorphism (AFLP). These methods permit the researcher…

Etude de la régulation du facteur de transcription ATB2 chez Medicago truncatula

2013

Rapport de stage de Master 2 Spécialité Biologie Intégrative des Interactions Plantes, Microbes, Environnement BAP GEAPSI; Master; Climatic changes since more than a century combined with the urge for better crop yields due to a huge demographic growth and coupled with the need for a more sustainable agriculture led to a number of stresses for plants. Understanding them and their effect on growth, seed quality and seed production of plants is one of the most important agronomical issues of our time. We have chosen to study legumes because they are a major lipid and protein source, as both food and feed, and for their unique ability to absorb the atmospheric nitrogen via a symbiosis with Rhi…

Évolution de la résistance aux herbicides chez l’Ambroisie (Ambrosia artemisiifolia) : recherche des déterminismes génétiques et application au diagn…

2021

National audience; L’ambroisie à feuilles d’armoise impacte à la fois la production agricole (plante adventice) etla santé publique (pollen allergisant et allergénique). Les inhibiteurs de l’acétolactate synthase(ALS), une famille d’herbicides, représentent aujourd’hui le levier le plus efficace pour lacontrôler. Cependant, des résistances à ces herbicides ont été identifiées chez l’ambroisie,entrainant des échecs de traitements. Les données disponibles montrent la présence derésistance liée à la cible (RLC, mutations structurales de l’ALS), mais l’essentiel de larésistance est lié à des mécanismes non liés à la cible (RNLC, modifications de la régulation oudes effecteurs du métabolisme sec…

Conception d’un dispositif d’acquisition d’images agronomiques 3D en extérieur et développement des traitements associés pour la détection et la reco…

2013

Thèse de Doctorat Sciences pour l’Ingénieur et Microtechniques, Spécialité Instrumentation et Information de l’Image Agrosup ECOLDUR (2013); Dans le cadre de l’acquisition de l’information de profondeur de scènes texturées, un processus d’estimation de la profondeur basé sur la méthode de reconstruction 3D « Shape from Focus » est présenté dans ce manuscrit. Les deux étapes fondamentales de cette approche sont l’acquisition de la séquence d’images de la scène par sectionnement optique et l’évaluation de la netteté locale pour chaque pixel des images acquises. Deux systèmes d’acquisition de cette séquence d’images sont présentés ainsi que les traitements permettant d’exploiter celle-ci pour …