0000000000203264
AUTHOR
Elīna ČErnooka
showing 2 related works from this author
Bakteriofāga Enc34 replikācijas moduļa proteīnu ekspresija, attīrīšana un raksturošana
2016
Darbā tika veikta bakteriofāga Enc34 replikācijas moduļa proteīnu sekvenču analīze un hipotētisko proteīnu ORF3, ORF4, ORF5 un ORF6 eksperimentāla izpēte ar mērķi identificēt to funkcijas. Pētījumu rezultātā praimāzei ORF1 tika atklāts iepriekš neidentificēts helikāzes domēns un ORF8 tika re-anotēts kā resolvāze. Rekombinanti producēts ORF4 bija nešķīstošs, savukārt ORF3 un ORF5 – šķīstoši, un to sekmīga attīrīšana ļauj darbu turpināt ar proteīnu kristalizāciju. ORF6 un delēcijas variantam ORF6Δ21 tika noteiktas kristālstruktūras, kuru analīze kopā ar in vitro eksperimentiem parādīja, ka ORF6 ir ssDNS saistošais proteīns (SSB). Pētījumā pirmoreiz tika atklāta SSB C-terminālā reģiona nozīme …
Bakteriofāga Enc34 replikācijas moduļa proteīna ORF6 struktūras noteikšana un analīze
2014
Pašlaik genoma datubāzēs ir deponētas vairāk nekā 1200 bakteriofāgu (fāgu) genomu sekvences. Vairums fāgu proteīnu tiek apzīmēti kā konservatīvi vai hipotētiski, un to struktūra un funkcijas pašlaik nav zināmas. Darba mērķis bija noteikt fāga Enc34 proteīna ORF6 terciāro struktūru un prognozēt tā funkciju. Pētījumā sekmīgi tika veikta natīva un ar selenometionīnu iezīmēta ORF6 proteīna ekspresija, attīrīšana un kristalizācija. Ar rentgenstaru kristalogrāfiju noteiktajai ORF6 struktūrai ir ssDNS saistošiem proteīniem (SSB) raksturīga uzbūve ar oligonukleotīdu/oligosaharīdu saistīšanas folda domēnu un nestrukturētu C-terminālo segmentu. Par ORF6 piederību SSB saimei liecina arī strukturālā ho…