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Gabriel Reboux

Factors associated with Pneumocystis colonization and circulating genotypes in chronic obstructive pulmonary disease patients with acute exacerbation or at stable state and their homes

Abstract Pneumocystis jirovecii colonization is frequent during chronic obstructive pulmonary disease (COPD) and patients constitute potential contributors to its interhuman circulation. However, the existence of an environmental reservoir cannot be excluded. We assessed the prevalence and factors associated with Pneumocystis colonization during COPD, and studied circulation between patients and their domestic environment. Pneumocystis molecular detection and mtLSU genotyping were performed in oro-pharyngeal washes (OPW) sampled in 58 patients with COPD acute exacerbation, and in indoor dust, sampled in patients’ homes using electrostatic dust collectors (EDCs). Lung and systemic inflammati…

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Résistance aux antifongiques azolés d’origine environnementale : quelles alternatives pour l’avenir ?

Azole resistant Aspergillus fumigatus strains are increasingly reported in many countries. One resistance mechanism is attributed to the use of azole fungicides in environment. Two mutations, TR34/L98H and TR46/Y121F/T289A, on the cyp51A gene, have been described. Results of 40 publications about azole resistant strain detections, with TR34/L98H and TR46/Y121F/T289A mutations, in clinical and/or environmental samples, are presented in this review. These cases, observed in many countries, suggest spreading phenomenon. Measures to moderate fungicides treatments and/or alternative treatments in environment should be established to preserve the effectiveness of azole antifungal therapy for at-r…

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Impact of domestic mould exposure on Aspergillus biomarkers and lung function in patients with chronic obstructive pulmonary disease

International audience; Patients with chronic obstructive pulmonary disease (COPD) are frequently colonised or sensitised by Aspergillus, but clinical significance remains unclear. Furthermore, little is known on the impact of indoor mould exposure during COPD. In this study, we assessed the relationship between domestic mould exposure, Aspergillus biomarkers and COPD severity during acute exacerbation and at stable state. Aspergillus section Fumigati culture in sputum and anti-Aspergillus antibodies detection (IgG and precipitins) were followed up in COPD patients that were prospectively recruited during exacerbation (n = 62), and underwent a visit at stable state after 18 months (n = 33).…

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Génotypage d’ Exophiala dermatitidis par polymorphisme des microsatellites et suivi de la colonisation des patients atteints de mucoviscidose

De nombreux micromycetes peuvent coloniser et infecter les voies respiratoires des patients atteints de mucoviscidose. Les « levures noires » du genre Exophiala sont retrouvees chez 2 a 20 % de ces patients et des cas d’infections pulmonaires prouvees ont ete decrits. L’espece Exophiala dermatitidis represente plus de 90 % des souches isolees de ces patients. L’objectif de ce travail a ete de developper une technique de genotypage d’E. dermatitidis par analyse du polymorphisme de microsatellites, et de l’appliquer aux souches de patients atteints de mucoviscidose suivis au CHRU de Besancon colonises par E. dermatitidis . Treize marqueurs microsatellites ont ete identifies et testes sur un p…

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Emergence of Aspergillus fumigatus azole resistance in azole-naïve patients with chronic obstructive pulmonary disease and their homes.

Azole-resistant Aspergillus fumigatus (ARAF) has been reported in patients with chronic obstructive pulmonary disease (COPD) but has not been specifically assessed so far. Here, we evaluated ARAF prevalence in azole-naïve COPD patients and their homes, and assessed whether CYP51A mutations were similar in clinical and environmental reservoirs. Sixty respiratory samples from 41 COPD patients with acute exacerbation and environmental samples from 36 of these patient's homes were prospectively collected. A. fumigatus was detected in respiratory samples from 11 of 41 patients (27%) and in 15 of 36 domiciles (42%). Cyp51A sequencing and selection on itraconazole medium of clinical (n = 68) and e…

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Méthodes d’identification et de quantification des moisissures de l’habitat : méthodes classiques, méthodes moléculaires

Resume Introduction Pour apprehender les repercussions de l’inhalation constante et inevitable de spores de moisissures il est necessaire de les prelever, les identifier et les quantifier. Etat des lieux Les prelevements sont de trois types : (i) surfaces, de realisation facile mais non quantifiables, (ii) air, faciles a calibrer mais limites dans le temps, et (iii) poussieres, plus representatifs dans le temps d’une exposition aux moisissures. La strategie d’echantillonnage depend des objectifs (exposition des personnes, objectiver la contamination, efficacite de la remediation). L’identification des colonies obtenues en culture est realisee par microscopie, Maldi-TOF, et/ou par sequencage…

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Activité du conseil médical en environnement intérieur (CMEI) en Bourgogne : évaluation auprès des médecins et des patients

Resume Depuis decembre 2009, les pneumologues et allergologues bourguignons peuvent faire appel a un conseiller medical en environnement interieur (CMEI). Les interventions, gratuites pour le patient, sont realisees sur recommandation medicale apres tests cutanes systematiques. Objectifs Decrire les indications et la repartition des prescriptions et mesurer l’impact de la visite a six mois sur les 100 premiers patients et a 18 mois aupres des medecins. Methode Entretien telephonique des 67 medecins (prescripteurs ou non) sur leurs motivations et/ou leurs attentes et des 100 premiers patients sur le suivi des recommandations. Resultats Soixante-dix pour cent des medecins ont repondu ( n  = 4…

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Impact de l’exposition domestique aux moisissures sur le risque de colonisation ou sensibilisation par Aspergillus fumigatus des patients atteints de BPCO

Objectif Les patients atteints de BPCO sont frequemment colonises par Aspergillus fumigatus (49–87 %) et a risque de developper des formes invasives d’aspergillose dont la mortalite est importante et l’incidence (environ 2 %) probablement sous-estimee. Afin de mieux comprendre le role de l’exposition environnementale aux moisissures dans ces infections, nous avons caracterise la flore fongique domiciliaire de patients atteints de BPCO et evalue son impact sur le risque de colonisation et sensibilisation fongiques par A. fumigatus . Methodes Soixante-deux patients ont ete prospectivement recrutes au CHRU de Lille entre aout 2011 et novembre 2015. La flore fongique domiciliaire a ete caracter…

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Identification et spécificité d’espèce des protéines d’intérêt pour le diagnostic sérologique de la maladie du poumon d’éleveur d’oiseaux

Introduction La maladie du poumon d’eleveur d’oiseaux (PEO) est une pneumopathie d’hypersensibilite liee a l’inhalation repetee de proteines antigeniques localisees entre autre, dans les fientes des oiseaux. Actuellement on connait peu de chose sur la nature de ces proteines. La serologie occupe une place importante dans le diagnostic, toutefois, celle-ci manque de specificite et de standardisation. Les objectifs consistent a evaluer la specificite des proteines antigeniques impliquees dans le PEO vis-a-vis de differentes especes aviaires et a identifier les proteines d’interet contenues dans les fientes de pigeon. Methodes Une comparaison des proteines des fientes de deux races de pigeon, …

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Azole-resistant Aspergillus fumigatus: A global phenomenon originating in the environment?

Abstract Aspergillus fumigatus is the predominant etiological agent of invasive aspergillosis (IA), a difficult-to-manage fungal disease associated with a high case fatality rate. Azole antifungals, particularly voriconazole, have significantly improved the survival rate of patients with IA. However, the clinical advances made possible through the use of medical azoles could be threatened by the emergence of azole-resistant strains which has been reported in an ever-increasing number of countries over the last 10 years. The major resistance mechanism, that combines point mutation(s) in the coding sequence of cyp51A gene and an insertion of a tandem repeat in the promoter region of this gene…

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L’acarien transporteur d’allergènes

Resume Les acariens et les moisissures cohabitent dans les logements. Ils sont les principaux allergenes impliques dans l’asthme allergique. Dans les silos a grains et les archives, les acariens transportent des spores et contaminent leurs environnements. Les acariens, par leurs choix alimentaires, selectionnent certaines especes. Sous l’action de spores, la liberation de la guanine et d’acides gras favorisent l’accouplement des acariens. La competition intervient egalement entre les acariens pour la colonisation de leur habitat. Les acariens presentent des tailles et des capacites de deplacement variables et certaines especes peuvent donc s’imposer au detriment d’autres. Les conditions de …

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