0000000001039008
AUTHOR
Anastasija Rudņickiha
Ekstracelulārās vezikulās ietvertās mikrobiālās RNS atklāšana cilvēku asins un urīna paraugos
Gandrīz visi cilvēka šūnu tipi sekretē ekstracelulārās vezikulas (EVs), un tām ir svarīga loma starpšūnu komunikācijā. Jaunākie pētījumi liecina, ka komunikācija notiek arī starp cilvēka mikrobiotu un saimniekorganisma šūnām. Šajā pētījumā mēs parādām, ka no cilvēka asinīm un urīna izdalītās EVs satur RNS fragmentus no dažādiem mikroorganismiem. Visbiežāk sastopami baktēriju tipi un supertipi asinīs un urīnā bija Proteobacteria, PVC grupa un Terrabacteria. Lai noteiktu vai šo mikrobiālo transkriptu galvenais avots ir zarnu mikrobioms, mēs izstrādājām EV izdalīšanas metodi no cilvēku fēču paraugiem. Tālāk mēs plānojām veikt RNS sekvencēšanas (RNA-seq) analīzi EV, kas izdalītas no plazmas, ur…
Plazmas miRNS kā multiplās sklerozes biomarķieri
Vairākos pētījumos ir atklātas miRNS, tajā skaitā cirkulējošas miRNS, kuru daudzums ir izmainīts multiplā sklerozē. miRNS kā jaunu biomarķieru izpēte šai slimībai varētu palīdzēt diagnosticēt un prognozēt tās attīstību agrīnā stadijā. Šajā pētījumā ir prezentēti mūsu dati par dažām miRNS, kas tikadetektētas MS pacientu asins plazmā, kā izmainītas. Mēs salīdzinājām miRNS ekspresijas līmeņus MS un tās apakštipos ar veselo kontroli, lai atrastu potenciālās miRNS, kas var tikt izmantotas, kā MS biomarķieri. Galvenais mērķis bija validēt sekvenēšanas rezultātā atlasītās miRNS, kuru daudzums bija izmainīts MS pacientu asins plazmā neatkarīgā pacientu kopā. miRNS 484, kuras daudzums bija visvairāk…
Detection of circulating miRNAs: comparative analysis of extracellular vesicle-incorporated miRNAs and cell-free miRNAs in whole plasma of prostate cancer patients.
Abstract Background Circulating cell-free miRNAs have emerged as promising minimally-invasive biomarkers for early detection, prognosis and monitoring of cancer. They can exist in the bloodstream incorporated into extracellular vesicles (EVs) and ribonucleoprotein complexes. However, it is still debated if EVs contain biologically meaningful amounts of miRNAs and may provide a better source of miRNA biomarkers than whole plasma. The aim of this study was to systematically compare the diagnostic potential of prostate cancer-associated miRNAs in whole plasma and in plasma EVs. Methods RNA was isolated from whole plasma and plasma EV samples from a well characterised cohort of 50 patient with …