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RESEARCH PRODUCT

Use of next generation sequencing technologies for the diagnosis and epidemiology of infectious diseases

Iñaki ComasFernando González-candelasGalo A. GoigCarla Mariner-llicerNeris García-gonzálezCarlos Francés-cuestaIrving Cancino-muñozPaula Ruiz-hueso

subject

0301 basic medicineMicrobiology (medical)GenomeComputer scienceDiagnósticoResistance030106 microbiologyResistenciasComputational biologyClinical Practice03 medical and health sciencesVigilancie0302 clinical medicineSecuenciación masivaEpimediologyNext generation sequencingVigilanciaDiagnosisEpidemiologíaRoutine clinical practiceGenomic information030212 general & internal medicineGenoma

description

[ES]: Por primera vez, la tecnología de secuenciación masiva permite acceder a la información genómica a un precio y a una escala tales, que se está implementado en la práctica clínica y epidemiológica rutinaria. Los obstáculos para dicha implementación son todavía muchos. Sin embargo, ya existen muchos ejemplos de las grandes ventajas que supone en comparación con métodos anteriores. Esto es, sobre todo, porque con una sola determinación podemos obtener simultáneamente información epidemiológica del microorganismo causante, así como de su perfil de resistencias, si bien estas ventajas están más o menos desarrolladas según el patógeno considerado. En esta revisión se repasan varios ejemplos del uso clínico y epidemiológico de la secuenciación masiva aplicada a genomas completos y microbiomas, y se reflexiona sobre su futuro en la práctica clínica.

https://doi.org/10.1016/j.eimc.2020.02.006