6533b88afe1ef96bd12e1ce6

RESEARCH PRODUCT

Assessment of microalgae species, biomass and distribution from spectral images using a convolution neural network

Salmi, PauliinaPölönen, IlkkaPääkkönen, SalliTaipale, SamiCalderini, Marco

subject

koneoppiminenmachine learningmicroalgaespektrikuvausspectral imagingmikrolevät

description

Artikkeliin "Assessment of microalgae species, biomass and distribution from spectral images using a convolution neural network" liittyvä aineisto koostuu seuraavista osista: 1.Transmittanssi-hyperspektrikuvat levänäytteistä kuvattuina 24-kuoppalevyllä 2.Biomassamääritykset elektronisella solulaskurilla 3.Opetus- ja validointiaineisto konvoluutioneuroverkolle 4.Testiaineisto konvoluutioneuroverkolle 5.Opetus-, validointi- ja testiaineiston käsittelyyn käytetty Python koodi 6.Seitsemään eri malliin käytetty Python koodi ja mallit itsessään The data and code related to the article "Assessment of microalgae species, biomass and distribution from spectral images using a convolution neural network" consist of the following parts: 1.Spectral transmittance images of algal samples on 24-well plates 2.Biomass assessments by an electronic cell counter 3.Training and validation data for a convolution neural network 4.Test data for a convolution neural network 5.Python code for training and validation and test data processing 6.Python code for running three replicates of seven different topologies of a convolution neural network and the models themselves

http://urn.fi/URN:NBN:fi:jyu-202111085543