Search results for "lek"
showing 10 items of 2808 documents
1,4 - dihidropiridīna atvasinājumu (AV-153-sāļu) mijiedarbības izpēte pret c-Myc antiparalēlo kvadrupleksu, izmantojot UV/redzamo spektroskopiju
2020
Pedējos gados ievērojami pastiprinājusies uzmanība pret DNS guanīna kvadrupleksiem un to lomu onkoģenēzē. c-Myc proto-onkogēna pastiprināta ekspresija ir saistīta ar dažādiem cilvēka audzējiem, ka arī ar slikto prognozi. Līdz ar to DNS guanīna kvadrupleksu veidošana un stabilizācija C-myc promoter reģionos ir kritiska c-Myc trankripcijas inhibēšanai, tāpēc pēdējos gados aktīvi tiek meklēti savienojumi, kuri var stabilizēt G-kvadrupleksu struktūras un inhibēt c-Myc gēna ekspresiju. Šī pētījuma darba mērķis bija izpētīt 1,4-dihidropiridīna atvasinājumu (AV-153 sāļu un to analoga AV-154-Na sāls) spēju mijiedarboties ar antiparalēlo c-myc kvadrupleksu, kā arī spēju mijiedarboties ar vienpavadie…
Mitohondriālo saslimšanu molekulāro un bioķīmisko diagnostikas metožu izstrāde un pielietošana
2015
mtDNS mutāciju izraisīti traucējumi mitohondriju OXPHOS sistēmā var būt cēlonis smagām mitohondriālajām slimībām. Mitohondriālo slimību diagnostika ir komplicēta. Darba “Mitohondriālo saslimšanu molekulāro un bioķīmisko diagnostikas metožu izstrāde un pielietošana” mērķis bija ieviest klīniskajā praksē molekulārās un bioķīmiskās metodes mitohondriālo slimību diagnostikai, izmantojot perifērās asinis. Tika veikta mtDNS sekvenēšana, heteroplazmijas analīze, elpošanas ķēdes kompleksa I aktivitātes, ATF daudzuma un ADF/ATF attiecības noteikšana perifērajos leikocītos. Divās no 63 analizētajām mtDNS sekvencēm tika atrastas mutācijas, kas saistītas ar mitohondriālajām saslimšanām. Tika izveidotas…
Charge Pair Interactions in Transmembrane Helices and Turn Propensity of the Connecting Sequence Promote Helical Hairpin Insertion
2013
alpha-Helical hairpins, consisting of a pair of closely spaced transmembrane (TM) helices that are connected by a short interfacial turn, are the simplest structural motifs found in multi-spanning membrane proteins. In naturally occurring hairpins, the presence of polar residues is common and predicted to complicate membrane insertion. We postulate that the pre-packing process offsets any energetic cost of allocating polar and charged residues within the hydrophobic environment of biological membranes. Consistent with this idea, we provide here experimental evidence demonstrating that helical hairpin insertion into biological membranes can be driven by electrostatic interactions between clo…
Confinement inside a Crystalline Sponge Induces Pyrrole To Form N−H⋅⋅⋅π Bonded Tetramers
2021
Based on the DFT‐level calculated molecular volume (V mol ) of pyrrole and its liquid density, pyrrole manifests the highest liquid density coefficient LD c (defined as [V mol • density • 0.6023]/FW) value of 0.7. Normal liquids have LD c < 0.63. This very high LD c is due to the strong N‐H … π interactions in solution and hence pyrrole can be considered to be a pseudo‐crystalline liquid. When trapped inside the confined space of the crystalline sponge a reorientation of the N‐H … π interaction is observed leading to specific cyclic N‐H … π tetramers and N‐H … π dimers, verified by single crystal X‐ray crystallographic and computational methods. These tetramers are of the same size as four …
Modulation of Structural Heterogeneity Controls Phytochrome Photoswitching
2019
Phytochromes sense red/far-red light and control many biological processes in plants, fungi, and bacteria. Although crystal structures of dark and light adapted states have been determined, the molecular mechanisms underlying photoactivation remains elusive. Here we demonstrate that the conserved tongue region of the PHY domain of a 57kDa photosensory module of Deinococcus radiodurans phytochrome, changes from a structurally heterogeneous dark state to an ordered light activated state. The results were obtained in solution by utilizing a laser-triggered activation approach detected on the atomic level with high-resolution protein NMR spectroscopy. The data suggest that photosignaling of phy…
A supramolecular system that strictly follows the binding mechanism of conformational selection
2020
Induced fit and conformational selection are two dominant binding mechanisms in biology. Although induced fit has been widely accepted by supramolecular chemists, conformational selection is rarely studied with synthetic systems. In the present research, we report a macrocyclic host whose binding mechanism is unambiguously assigned to conformational selection. The kinetic and thermodynamic aspects of this system are studied in great detail. It reveals that the kinetic equation commonly used for conformational selection is strictly followed here. In addition, two mathematical models are developed to determine the association constants of the same guest to the two host conformations. A “confo…
Structural mechanism of signal transduction in a phytochrome histidine kinase
2022
AbstractPhytochrome proteins detect red/far-red light to guide the growth, motion, development and reproduction in plants, fungi, and bacteria. Bacterial phytochromes commonly function as an entrance signal in two-component sensory systems. Despite the availability of three-dimensional structures of phytochromes and other two-component proteins, the conformational changes, which lead to activation of the protein, are not understood. We reveal cryo electron microscopy structures of the complete phytochrome from Deinoccocus radiodurans in its resting and photoactivated states at 3.6 Å and 3.5 Å resolution, respectively. Upon photoactivation, the photosensory core module hardly changes its ter…
1,4-dihidropiridīna atvasinājumu ietekme uz DNS reparācijas un proteolīzes enzīmu ekspresiju cukura diabēta modelī un DNS divpavedienu pārrāvumu līme…
2019
1,4 dihidropiridīna (1,4 DHP) atvasinājumi ir organiskie savienojumi ar dažādām farmakoloģiskām aktivitātēm. Darba mērķis bija noskaidrot 1,4 DHP atvasinājumu ietekmi uz DNS reparācijas un proteolīzes enzīmu ekspresiju žurkās cukura diabēta modelī un DNS divpavedienu pārrāvumu līmeni ar Tat proteīnu transficētos B limfocītos. Iegūtie dati liecina, ka 1,4 DHP atvasinājumi spēj modulēt DNS reparācijā iesaistīto PARP1 un H2AX proteīnu un gēnu ekspresiju, Xdh gēna ekspresiju un proteolīzē iesaistīto Psma3, Psma6, Psmb5 un Psmc6 gēnu ekspresiju žurkās cukura diabēta modelī ar atšķirīgu ietekmi dažādos orgānos un iespējamu terapeitisku efektu. Turklāt pētītie savienojumi pasargā DNS molekulu no T…
Garķēžu acilkarnitīnu patofizioloģiskās funkcijas šūnas un organisma līmenī
2021
Paaugstināts garķēžu acilkarnitīnu (GĶAK) līmenis plazmā tiek saistīts ar insulīna rezistenci, tomēr precīzi šīs saistības mehānismi nav zināmi. Darba mērķis ir identificēt GĶAK izraisītās insulīna rezistences molekulāros mehānismus, un novērtēt diagnostikas potenciālu GĶAK mērījumiem plazmā. Mēs parādām, ka palmitoilkarnitīns kavē insulīna signāla pārnesi, samazinot insulīna receptora fosforilāciju, tādējādi šūnu līmenī izraisot traucējumus insulīna jutībā. GĶAK profilu plazmā galvenokārt nosaka sirds audi, tiem reaģējot uz enerģijas substrātu pieejamību. Nepietiekams GĶAK koncentrācijas samazinājums plazmā pēc glikozes ievadīšanas liecina par sirds audu insulīna rezistenci. Pētījumā aprak…
Hipofīzes audzēju patoģenēzes biomolekulāro mehānismu izpēte
2022
Darbā analizētas hipofīzes šūnu kultūru biomolekulārās īpašības un no hipofīzes izcelsmes šūnām brīvās DNS molekulu klātbūtne pacientu asins plazmā. Tika konstatēts, ka viena no šūnu kultūrām ir multipotentas mezinhimāli stromālās šūnas, kas visticamāk nav galvenā PitNET šūnu populācija, bet, iespējams, tai ir audzēja darbību atbalstoša loma. Otra šūnu kultūra ir hipofīzes sfēru veidojošas šūnas, kuras visticamāk, veido audzēja galveno audu masu. Tām bija kopīgas ģenētiskās iezīmes ar galveno audzēja masu. Analizējot pacientu šķidrās biopsijas, tika atklāts, ka PitNET audu paraugos atrastās somatiskās mutācijas ar dažādu jutību ir konstatējamas arī šūnu brīvajā DNS. Atslēgvārdi: hipofīzes n…