Search results for "metagenoms"
showing 4 items of 4 documents
Cilvēka zarnu mikrobioma salīdzinājums pacientiem ar dažādu 2.tipa cukura diabēta ilgumu un terapiju veidiem
2021
Maģistra darba izstrādes laikā iegūti rezultāti par zarnu mikrobioma taksonomiskā sastāva atšķirībām 270 pacientos ar 2. tipa cukura diabēta (T2D) diagnozi, bet atšķirīgu tā ilgumu kopš diagnosticēšanas brīža un pielietotajām antidiabētiskajām terapijām. Darba mērķis bija noskaidrot, kā šīm T2D pacientu apakšgrupām atšķiras zarnu mikrobioma taksonomiskais profils. Mikrobiālajai DNS, kas iegūta no fēču paraugiem, tika veikta visa metagenoma analīze ar lielapjoma paralēlo sekvenēšanu. Darba rezultāti apstiprināja vairākas zināmas asociācijas starp dažādām antidiabētiskajām terapijām un cilvēka zarnu mikrobiomu, kā arī iegūti jauni dati par zarnu mikrobioma taksonomiskajām atšķirībām indivīdos…
"15 Latvijas pilsētu notekūdeņu metagenoma taksonomiskais un funkcionālais raksturojums"
2021
Neattīrīti notekūdeņi ir ķīmiski un bioloģiski kompleksa vide, taču tā mikrobioloģiskais sastāvs līdz šim ir maz pētīts. Izmantojot šobrīd pieejamās sekvencēšanas un bioinformātikas tehnoloģijas, ir iespējams raksturot notekūdeņu mikroorganismu kopienas sastāvu dažādos līmeņos. Bakalaura darba mērķis bija taksonomiski un funkcionāli raksturot 15 Latvijas pilsētu notekūdeņu metagenomus. DNS tika izdalīta no neattīrītu, 24 h periodā ievāktu koncentrētu notekūdeņu paraugiem, un tai, izmantojot lielapjoma paralēlo sekvencēšanu, tika veikta visa metagenoma analīze. Datu analīzes rezultātā tika noskaidrots, ka pilsētu notekūdeņu metagenomos ir saskatāmas līdzības sugu, ģints, tipa un gēnu līmeņos…
Antidiabētiskā medikamenta metformīna izraisītās funkcionālās izmaiņas cilvēka zarnu mikrobiomā
2018
Metformīns ir antidiabētisks medikaments, kas samazina glikozes līmeni asinīs un nerada hipoglikēmiju, tomēr ~25% pacientu attīstās gastrointestinālas blaknes. Ir veikti pētījumi par metformīna terapijas ietekmi uz 2. tipa cukura diabēta pacientu zarnu mikrobiomu, tomēr pilnīga metformīna un zarnu mikrobioma mijiedarbības raksturojuma joprojām nav. Darba mērķis bija noskaidrot, kā metformīns ietekmē vesela cilvēka zarnu mikrobioma taksonomisko un funkcionālo profilu. Mikrobiālajai DNS no fēču paraugiem tika veikta metagenoma analīze ar lielapjoma paralēlo sekvenēšanu. Rezultāti parāda vairākas izmaiņu tendences gan taksonomisko grupu, gan signālceļu un gēnu saimju īpatsvarā jau 24 stundas p…
Saimniekorganisma miRNS un zarnu mikrobioma mijiedarbība dažādos kolonoskopijas izmeklējumu paraugos
2022
Cilvēka gastrointestinālajā traktā ir daudzveidīgs mikrobioms, kam ir būtiska loma veselības uzturēšanā un fizioloģisko funkciju veikšanā organismā. Mikrobioma traucējumi ietekmē imūnsistēmas funkcijas, vielmaiņu, kā arī saistīti ar dažādām slimībām. MikroRNS (miRNS) ir nozīmīga loma gēnu ekspresijas regulēšanā. Pētījumos noskaidrots, ka saimniekorganisma miRNS tieši ietekmē zarnu mikrobiomu, tādējādi potenciāli nodrošinot daudzsološu stratēģiju, lai mērķtiecīgi modificētu mikrobiomu. Lai noskaidrotu, vai pacientu, kuriem dažādu iemeslu dēļ ir veikta kolonoskopija, zarnu biopsiju miRNS korelē ar fēču mikrobiomu veikta mazo RNS un metagenoma sekvencēšana. MiR200, miR-151, miR-30 saimes pozit…