Agrégation de données spatiales hétérogènes pour l’évaluation d’un modèle

National audience

Coexistence of rapeseed varieties in time and space : using GeneSys model to adapt cropping systems

International audience

Avis en réponse à la saisine HCB – dossier RX-016, Paris le 21 février 2019

Le Haut Conseil des biotechnologies (HCB) a été saisi sur le fondement du règlement (CE) n° 1829/2003 d’une demande d’avis relative au dossier EFSA-GMO-RX-016 dans le but de proposer des commentaires à destination de l’EFSA en contribution à l’évaluation européenne du dossier, et d’éclairer les autorités compétentes françaises dans une étape intermédiaire en amont du vote à la Commission européenne. Déposé par la société Syngenta Crop Protection NV/SA, ce dossier est une demande de renouvellement d’autorisation de mise sur le marché du maïs génétiquement modifié Bt11 à des fins d’importation, transformation, et alimentation humaine et animale dans l’Union européenne.

Avis en réponse à la saisine HCB - dossier C/NL/06/01_001. Paris, le 17 octobre 2018

Le Haut Conseil des biotechnologies (HCB) a été saisi le 14 août 2018 par les autorités compétentes françaises (le ministère de l’Agriculture et de l’Alimentation) d’une demande d’avis relative au dossier C/NL/06/01_001 de demande de renouvellement d’autorisation de mise sur le marché de la lignée d’oeillets génétiquement modifiés 123.8.12 (identificateur unique FLO- 40689-6) à des fins d’importation et de commercialisation de fleurs coupées. Ce dossier a été déposé par la société Suntory Flowers Limited auprès des autorités compétentes néerlandaises sur le fondement de la directive 2001/18/CE. Conformément à cette directive, la Commission européenne a adressé le rapport d’évaluation des Pa…

Modélisation de la dispersion de transgènes à l'échelle de paysages agricoles

Rapport scientifique de fin de contrat. Appel d'offres : impact des OGM

Zoom sur ... CoSAC (anr-14-ce18-0007) Conception de Stratégies durables de gestion des Adventices dans un contexte de Changement (climat, pratiques agricoles, biodiversité)

National audience

Conception de Stratégies durables de gestion des Adventices dans un contexte de Changement : le projet CoSAC

International audience; La flore adventice est nuisible pour la production agricole mais est aussi l’un des piliers de la biodiversité dans les paysages agricoles.La réduction de l'usage d'herbicides demandée par le plan ECOPHYTO, implique que la gestion des adventices dorénavant combinel'ensemble des leviers du système de culture. L'objectif du projet CoSAC était de concevoir, d’évaluer et de promouvoir des systèmesde culture conciliant réduction d'usage des herbicides, maintien de la production agricole et préservation de la biodiversité. Pourcela, il était nécessaire de : (1) mieux comprendre et prédire le fonctionnement de l'agroécosystème, notamment les mécanismesbiophysiques régissant…

GENESYS, un modèle pour évaluer et concevoir des systèmes de coexistence

National audience

Using the GeneSys model quantifying the effect of cropping systems on gene flow from GM rape varieties to rape volunteers for evaluating and designing scenarios for co-existence of GM, non-GM and organic crops

International audience

Assessing the indirect and long-term ecological impacts of innovation in agriculture is a real challenge: the GM example

All innovation in agriculture constitutes a significant and complex ecological disturbance, even if limited to a single and simple action. Indeed, whatever the nature and objective of the action, a large number of ecological processes are affected and numerous discontinuities may occur within the agro-ecosystem, in both time and space. As the GMO example illustrates, it is not sufficient to focus on direct effect of innovation, it is necessary to forecast mid- and long-term impacts of innovation with respect to the environment. Modelling phenomena appear then to be a key element to achieve this goal.

Neutral modelling of agricultural landscapes by tessellation methods: the GenExP-LandSiTes software - Application to the simulation of gene flow

International audience; We present a three steps approach that aimed at simulating neutral agricultural landscape models: (1) we characterized the geometry of three real field patterns; (2) we generated simulated field patterns with two tessellation methods attempting to control the value of some of the observed characteristics and, (3) we evaluated the simulated field patterns. The first two steps were integrated to the GenExP-LandSiTes software that thus simulates two-dimensional agricultural landscapes. It is written in Java, and it is freely accessible through a Gnu Public Licence. For the third step, we considered that good simulated field patterns should capture characteristics of rea…

Avis en réponse à la saisine du 2 juillet 2020 relative au projet de décret modifiant l’article D.531-2 du code de l'environnement

Les analyses contenues dans le rapport de surveillance de Bayer Agriculture BVBA ne font apparaître aucun problème majeur associé à la culture de maïs MON 810 en 2018. Toutefois, le CS du HCB identifie encore certaines faiblesses et limites méthodologiques concernant la surveillance de la sensibilité des ravageurs ciblés à la toxine Cry1Ab, remettant en question les conclusions du rapport. Le HCB estime notamment que l’utilisation d’une dose diagnostic présente certaines limites pour la détection précoce de l’évolution de la résistance, tant dans son principe intrinsèque que dans sa mise en oeuvre par Bayer, et recommande une méthode alternative de type F2 screen permettant de déterminer la…

Evaluation and use of a spatio-temporal model of cropping system effects on gene escape from transgenic oilseed rape varieties. Example of the GENESYS model applied to three co-existing herbicide tolerance transgenes

International audience

Gestion des adventices dans les systèmes avec colza

Les adventices ou « mauvaises herbes » sont les principaux bioagresseurs des cultures. Elles occasionnent des pertes considérables à la fois en quantité et en qualité. Les agriculteurs cherchent donc à les combattre. Pour cela, la tendance actuelle est de développer les méthodes alternatives à l’emploi d’herbicides chimiques. Voyons comment la recherche y travaille dans le cas des systèmes de culture avec colza. Contexte - L’objet du GIS GC-HP2E est de rapprocher la recherche du développement sur le thème de la double performance économique et environnementale en grandes cultures. Le plan Ecophyto visant une réduction d’usage des produits phytopharmaceutiques chimiques, et les adventices ét…

Innovative cropping systems design and multicriteria assessment

Relevance of modelling for assessing spatial and temporal effects of GMOs - upscaling

International audience; Gene flow is a common phenomenon for crop species and its implications for Genetically Modified Plants have raised new concerns. Undesirable effects related to gene flow may result in ecological or agronomic considerations (persistence of feral plants, creation of new weeds; impacts on biodiversity) as well as in commercial considerations (adventitious presence of GMOs in conventional crop production affecting its competitiveness in the marketplace). Consequently, the coexistence between different types of crops has become a major issue and has to be addressed per se whatever are the actual ecological, agronomic and safety impacts. On-farm gene flow occurs both in ti…

Commentaires sur le rapport de surveillance de culture du MON 810 en 2018. Paris, le 25 février 2020

Les analyses contenues dans le rapport de surveillance de Bayer Agriculture BVBA ne font apparaître aucun problème majeur associé à la culture de maïs MON 810 en 2018. Toutefois, le CS du HCB identifie encore certaines faiblesses et limites méthodologiques concernant la surveillance de la sensibilité des ravageurs ciblés à la toxine Cry1Ab, remettant en question les conclusions du rapport. Le HCB estime notamment que l’utilisation d’une dose diagnostic présente certaines limites pour la détection précoce de l’évolution de la résistance, tant dans son principe intrinsèque que dans sa mise en oeuvre par Bayer, et recommande une méthode alternative de type F2 screen permettant de déterminer la…

Utilisation du modèle FLORSYS comme outil d’aide à la conception de systèmes de cul-ture innovants performants pour la gestion durable des adventices : exemple d’un groupe DEPHY Ferme de l’Eure

International audience; Les systèmes de culture d’un groupe DEPHY Ferme de l’Eure, majoritairement spécialisé en grande culture, ont été évalués avec le modèle de dynamique de la flore adventice FLORSYS. Les objectifs de ce groupe sont l’amélioration de la durabilité de leurs systèmes et le maintien ou la réduction de leur utilisation de produits phytosanitaires, dont les herbicides (avec un Indice de Fréquence de Traitement herbicides de 1,2 en moyenne). L’évaluation porte sur une étape de l’innovation, en comparant le système de culture actuelle-ment pratiqué aux systèmes innovants envisagés pour chaque agriculteur membre du groupe. Sur 17 sys-tèmes innovants évalués, 7 permettraient une …

Organisation scientifique du colloque

National audience

Évaluation par simulation des performances et de la durabilité de systèmes de culture innovants pour la gestion durable des adventices : exemple d’un groupe DEPHY Ferme de l’Eure

International audience; Les systèmes de culture d’un groupe DEPHY Ferme de l’Eure, majoritairement spécialisé en grande culture, ont été évalués avec le modèle de dynamique adventice FLORSYS. Les objectifs de ce groupe sont l’amélioration de la durabilité de leurs systèmes et le maintien ou la réduction de leur utilisation de produits phytosanitaires, dont les herbicides. L’évaluation porte sur une étape de l’innovation, en comparant le système de culture actuellement pratiqué aux systèmes innovants envisagés. Avec un indice de fréquence de traitement (IFT) herbicides moyen de 1,2 dans les systèmes de culture pratiqués, les systèmes innovants proposés par les agriculteurs permettent (à deux…

Management of herbicide-resistant weed beet: a simulation study

International audience; In regions of sugar beet cultivation, weed beet infestations are responsible for economic losses. Weed beet belongs to the same species as the cropped plant, thus rendering herbicide control impossible in conventional sugar beet where costly practices such as manual weeding of bolters must be carried out instead. Genetically-modified herbicide-tolerant (GMHT) sugar beet varieties might provide an alternative in fields heavily infested with weed beet. However, accidental bolting of GMHT plants would result in pollen-mediated transgene flow towards weed beets. The objective of the present paper was to use a spatiotemporal simulation model for comparing three production…

Commentaires sur le projet de document consensus de l’OCDE sur les considérations environnementales relatives à l’évaluation des risques associé. Paris, le 23 mai 2018

Le Haut Conseil des biotechnologies (HCB) a été sollicité le 4 avril 2018 par la direction générale de l’alimentation du ministère de l’Agriculture et de l’Alimentation et par la direction générale de la prévention des risques du ministère de la Transition écologique et solidaire pour examiner et commenter le projet de document consensus de l’OCDE (version du 3 avril 2018) sur les considérations environnementales relatives à l’évaluation des risques associés à la dissémination de plantes génétiquement modifiées en vue de la réunion du groupe de travail de l’OCDE sur l’harmonisation de la surveillance réglementaire en biotechnologie les 21 et 22 juin 2018. Le Comité scientifique (CS)1 du HCB…

Using the GeneSys model quantifying the effect of cropping systems on gene flow from GM rape varieties to rape volunteers for designing and evaluating scenarios for co-existence of GM, non-GM and organic crops

International audience

Introduction to gene flow modelling and co-existence

International audience

Avis en réponse à la saisine HCB- dossier 2019-159. Paris, le 16 décembre 2019

Le Haut Conseil des biotechnologies (HCB) a été saisi sur le fondement du règlement (CE) n° 1829/2003 d’une demande d’avis relative au dossier EFSA-GMO-NL-2019-159 dans le but de proposer des commentaires à destination de l’EFSA en contribution à l’évaluation européenne du dossier, et d’éclairer les autorités compétentes françaises dans une étape intermédiaire en amont du vote à la Commission européenne. Déposé par la société Pioneer Hi-Bred International, Inc., ce dossier est une demande d’autorisation de mise sur le marché du maïs génétiquement modifié DP202216 à des fins d’importation, de transformation et d’alimentation humaine et animale dans l’Union européenne.

Commentaires sur le rapport de surveillance de culture du MON 810 en 2017. Paris, le 23 décembre 2019

Les analyses contenues dans le rapport de surveillance de Monsanto ne font apparaître aucun problème majeur associé à la culture de maïs MON 810 en 2017. Cependant, le Comité scientifique (CS) du Haut Conseil des biotechnologies (HCB) a identifié une erreur significative d’analyse statistique remettant en question l’analyse du suivi de la sensibilité des sésamies à la toxine Cry1Ab, et suggérant un possible développement de résistance dans les populations du nord-est de la péninsule Ibérique. Par ailleurs, le CS du HCB identifie encore certaines faiblesses et limites méthodologiques concernant la surveillance de la résistance et la mise en oeuvre des zones refuges. Le HCB estime notamment q…

Analysis of necessary adjustments of farming practices

Using the GENESYS model quantifying the effect of cropping systems on gene escape from GM rape varieties to evaluate and design cropping systems.

Gene flow in rapeseed is a process taking place both in space and over the years and cannot be studied exclusively by field trials. Consequently, the GENESYS model was developed to quantify the effects of cropping systems on transgene escape from rapeseed crops to rapeseed volunteers in neighbour plots and in the subsequent crops. In the present work, this model was used to evaluate the risk of rape harvest contamination by extraneous genes in various farming systems in case of co-existing GM, conventional and organic crops. When 50 % of the rape varieties in the region were transgenic, the rate of GM seeds in non-GM crop harvests on farms with large fields was lower than the 0.9 % purity t…

Utilisation des modèles GeneSys-Colza et Mapod-Maïs pour raisonner des stratégies de ségrégation de filières et évaluer la faisabilité de certains seuils de pureté dans différents systèmes de culture et de production

National audience

Synthèse sur la détection des produits issus des nouvelles technologies génomiques (NGT) appliquées aux plantes. Paris, Paris, le 26 novembre 2021

Synthèse sur la détection des produits issus des nouvelles technologies génomiques (NGT) appliquées aux plantesLa question du statut réglementaire des NGT (New Genomic Techniques), qui ont été définies comme techniques de modification du génome « apparues » depuis 2001 , est actuellement débattue en Europe. Ces techniques n’existaient pas, ou étaient peu développées lors de l’adoption des directives et règlements européens qui encadrent actuellement les organismes génétiquement modifiés (OGM). A l’époque le législateur européen avait choisi de réglementer les techniques de transgénèse et d’exempter les méthodes de mutagénèse notamment sur la base d’une expérience d’usage n’ayant révélé aucu…

Modélisation des effets des systèmes de culture sur les flux géniques hors de nouvelles variétés de colza vers les repousses. Intégration et évaluation des effets variétaux

National audience

AVIS en réponse à la saisine HCB - dossier 2020-172. Paris, le 06 septembre 2021

Le Haut Conseil des biotechnologies (HCB) a été saisi le 22 juin 2021 par les autorités compétentes françaises (Ministère de l'Agriculture et de l'Alimentation) d'une demande d'avis relative au dossier EFSA-GMO-NL-2020-172 de demande d'autorisation de mise sur le marché du maïs génétiquement modifié DP915635 à des fins d'importation, transformation et alimentation humaine et animale. Ce dossier a été déposé par la société Pioneer Hi-Bred International, Inc. auprès des autorités compétentes néerlandaises sur le fondement du règlement (CE) n° 1829/2003. Dans le cadre de ce règlement, l'évaluation des dossiers de demande de mise sur le marché est confiée à l'Autorité européenne de sécurité des…

Using the GeneSys model quantifying the effect of cropping systems on gene flow from GM rape varieties to rape volunteers to evaluate and design cropping systems in agricultural regions

National audience

GENESYS: Modelling the influence of cropping systems and varieties on transgenic rapeseed volunteers' dispersal

International audience

CoSAC, un projet pour la Conception de Stratégies durables de gestion des Adventices dans un contexte de Changement : climat, pratiques agricoles, biodiversité). Introduction

SPEGESTAD INRA; Le projet CoSAC regroupe des partenaires de la recherche et du développement afin de (1) quantifier et comprendre, à l'aide d'expérimentations, les effets de pratiques agricoles innovantes sur les adventices et le fonctionnement de l'agroécosystème, (2) développer des outils prédisant les effets des pratiques agricoles et du pédoclimat sur la flore adventice, (3) utiliser ces outils pour concevoir des stratégies de gestion durable des adventices et d'évaluer leurs performances dans différents contextes de changements (pratiques agricoles, climat, biodiversité), (4) permettre l'adoption de ces stratégies innovantes par les agriculteurs. Le séminaire de mi-parcours présente le…

La gestion des betteraves adventices résistantes à un herbicide: une approche par simulation

National audience; Les variétés de betteraves sucrières génétiquement modifiées (GM) résistantes à un herbicide sont, a priori, intéressantes dans des champs fortement infestés par la betterave adventice. Cependant, la montée à fleurs de ces betteraves GM peut entraîner l’apparition d’individus résistants, via la dispersion de pollen. Nous avons développé et utilisé le modèle GENESYS-Betterave pour simuler, à l’échelle d’une petite région agricole, l’impact des pratiques culturales sur la dispersion du transgène. Il permet d'identifier des stratégies pour contrôler les adventices et limiter l'apparition de populations résistantes en zone de production de betterave sucrière. L’utilisation de…

Using the gene flow model GENESYS for evaluating and developing cropping systems for the co-existence of GM, conventional and organic crops

Actes du colloque ; Les entretiens du Pradel, 2004/09/08-10, Pradel (FRA) Informations issues du SUDOC; National audience

Coordination et édition de l'acte du colloque

National audience; Le projet CoSAC regroupe des partenaires de la recherche et du développement afin de (1) quantifier et comprendre, à l'aide d'expérimentations, les effets de pratiques agricoles innovantes sur les adventices et le fonctionnement de l'agroécosystème, (2) développer des outils prédisant les effets des pratiques agricoles et du pédoclimat sur la flore adventice, (3) utiliser ces outils pour concevoir des stratégies de gestion durable des adventices et évaluer leurs performances dans différents contextes de changements (pratiques agricoles, climat, biodiversité), (4) permettre l'adoption de ces stratégies innovantes par les agriculteurs. Ce séminaire final présente les résult…

Comparative study of the efficiency of buffer zones and harvest discarding on gene flow containment in oilseed rape. A modelling approach

International audience; Oilseed rape (OSR) genes can escape fields in space via pollen and seeds and in time via volunteers resulting from seeds lost before or during oilseed rape harvests. Previous simulation studies and field observations showed that co-existence at the landscape level of contrasting OSR varieties such as genetically modified (GM) and non-GM varieties require costly measures that are difficult to implement, such as isolation distances between OSR fields and stringent volunteer control in all fields and road margins. In the present study, two local strategies, non-GM buffer zones aroundGMfields and discarding the harvest of boundary plants of non-GM fields, were tested in …

GenExP, un logiciel simulateur de paysages agricoles pour l'étude de la diffusion de transgènes

 ; The software GENEXP allows to simulate 2-dimensional agricultural landscapes by using a traditional algorithmic geometry. Based on real or realistic field-patterns, GENEXP provides multiannual maps of agricultural landscapes, which are used by softwares simulating the dispersal of GM pollen grains and seeds at various scales.; GENEXP est un simulateur de paysages agricoles qui engendre des découpages parcellaires en utilisant une géométrie algorithmique classique. GENEXP fournit, sur la base de parcellaires réels ou réalistes, des cartes pluriannuelles de paysages agricoles utilisables par des logiciels qui simulent la dispersion des pollens et des graines d'OGM à différentes échelles.