6533b855fe1ef96bd12b12fd
RESEARCH PRODUCT
Genetic Diversity of White Clover (Trifolium Repens L.) from the Urban Area of Rīga Baltā Āboliņa (Trifolium Repens L.) Ģenētiskā Daudzveidība Rīgas Pilsētvidē
Kalvis AvotiņšDace GraudaIsaak RashalAgnese Kolodinska-brantestamOksana Fokinasubject
geographyGenetic diversityMultidisciplinaryWhite (horse)geography.geographical_feature_categoryGeneral interestbiologyScienceQgenetic diversityipbs methodUrban areabiology.organism_classificationurban environmentAgronomyTrifolium repenswhite cloverUrban environmentdescription
Baltais āboliņš (Trifolium repens L.) ir tauriņziežu dzimtas augs, plaši izplatīts gan pilsētvidē, gan ārpus tās. Tas tiek izmantots kā lauksaimniecības augs biomasas iegūšanai, un tā ir arī populāra daudzgadīgos zālienus veidojošā suga - pilsētvidē balto āboliņu sēj zālājos. Baltais āboliņš plaši pārstāvēts dažādos biotopos ar mainīgu ārējo faktoru ietekmi, tai skaitā pilsētvidē. Tādēļ tas ir piemērots modeļobjekts antropogēnās ietekmes pētīšanai. Darba mērķis bija noteikt baltā āboliņa Latvijas populācijas ģenētisko daudzveidību, izmantojot iPBS (inter primer binding sites) - uz retrotranspazoniem balstītu metodi. Iegūtie rezultāti salīdzināti starp trim augu paraugkopām: pilsētvidē augoši augi (Rīgas pilsētas teritorija), dabiskā vide (Latvijas novadu teritorijas) un selekcionētā šķirne 'Daile'. Lai gan polimorfo lokusu skaits visās pētītajās grupās bija augsts (89%), tomēr Šanona (Shannon) indekss, kas raksturo grupu iekšējo ģenētisko daudzveidību, pētāmajām grupām svārstījās tikai ap 0.3. Šāds rezultāts norāda uz to, ka iekšējo grupu polimorfismu nosaka neliels ģenētiski atšķirīgu augu skaits. Galveno koordināšu analīzē, kas balstīta uz Šanona indeksu, visi pētītie paraugi izveidoja trīs grupas. Vienā no tiem grupējās šķirnes 'Daile' augi, savukārt baltais āboliņš no pilsētvides un Latvijas reģioniem izveidoja divas atšķirīgas grupas.
year | journal | country | edition | language |
---|---|---|---|---|
2015-08-01 | Proceedings of the Latvian Academy of Sciences. Section B. Natural, Exact, and Applied Sciences. |