Search results for "Genoma"
showing 10 items of 40 documents
NO LATVIJAS NOTEKŪDEŅIEM JAUNIZDALĪTO AEROMONAS SALMONICIDA BAKTERIOFĀGU RAKSTUROŠANA
2022
Darbā aprakstīta no Jelgavas pilsētas notekūdeņiem izolētas un pēc 16S rRNS gēna sekvenēšanas identificētas baktērijas Aeromonas salmonicida subsp. salmonicida celma JK jaunizdalīto bakteriofāgu raksturošana. Īpaša uzmanība tiek pievērsta no tās pašas pilsētas notekūdeņu parauga izolētam Aeromonas fāgam JELG-KS1, kas potenciāli reprezentē ne tikai jaunu fāgu sugu, bet arī ģinti. Izvelētā fāga padziļinātai raksturošanai tika veikta fāga dzīvescikla, morfoloģijas un saimnieka inficētspējas aprakstīšana, virionu stabilitātes noteikšana mainīgos vides apstākļos, fāgu pilna genoma sekvenēšana un funkcionālā anotēšana, kā arī citas eksperimentālās darbības. Fāga JELG-KS1 anotētais pilnais genoms …
Novel virocell metabolic potential revealed in agricultural soils by virus-enriched soil metagenome analysis
2021
International audience; Viruses are now recognized as important players in microbial dynamics and biogeochemical cycles in the oceans. Yet, compared with aquatic ecosystems, virus discovery in terrestrial ecosystems has been challenging partly due to the inherent complexity of soils. To expand our understanding of soil viruses and their putative contributions to soil microbial processes, we analysed metagenomes of community-level virus-enriched suspensions by tangential flow filtration obtained from two French agricultural soils. We found viral sequences representing a total of 239 viral operational taxonomic units that corresponded to 29.5% of the mapping reads in the metagenomic datasets.…
Genomic Signature in Evolutionary Biology: A Review
2023
Organisms are unique physical entities in which information is stored and continuously processed. The digital nature of DNA sequences enables the construction of a dynamic information reservoir. However, the distinction between the hardware and software components in the information flow is crucial to identify the mechanisms generating specific genomic signatures. In this work, we perform a bibliometric analysis to identify the different purposes of looking for particular patterns in DNA sequences associated with a given phenotype. This study has enabled us to make a conceptual breakdown of the genomic signature and differentiate the leading applications. On the one hand, it refers to gene …
Comparative analysis of variation and selection in the HCV genome
2016
AbstractGenotype 1 of the hepatitis C virus (HCV) is the most prevalent of the variants of this virus. Its two main subtypes, HCV-1a and HCV-1b, are associated to differences in epidemic features and risk groups, despite sharing similar features in most biological properties. We have analyzed the impact of positive selection on the evolution of these variants using complete genome coding regions, and compared the levels of genetic variability and the distribution of positively selected sites. We have also compared the distributions of positively selected and conserved sites considering different factors such as RNA secondary structure, the presence of different epitopes (antibody, CD4 and C…
Dimēriskas dCas9-FokI sistēmas izveidošana efektīvai zīdītāju šūnu genoma rekombinēšanai
2015
CRISPR/Cas9 sistēma nodrošina robustu un plaši pielietojamu genoma rekombinēšanas tehnoloģiju, kas paver iespēju zinātniekiem precīzi manipulēt ar specifickiem genoma elementiem, ko izmantot gēnu funkciju pētījumos bioloģijā un slimību attīstībā. Darba mērķis bija izveidot un optimizēt dCas9-FokI sistēmu, kas nodrošinātu stabilu un specifisku genoma rekombinēšanu cilvēka šūnās. Mēs piedāvājam alternatīvu tehnoloģiju, kas ir balstīta uz RNS vadītu dCas9-FokI sistēmu un piedāvā ievērojamu genoma rekombinēšanas potenciālu ar samazinātu nespecifiskās šķelšanas (off-targeting) efektu. Iegūtie dati liecina, ka šī izveidotā sistēma var tikt efektīvi izmantota genoma rekombinēšanai zīdītāju šūnās. …
Functional impact and evolution of a novel human polymorphic inversion that disrupts a gene and creates a fusion transcript
2015
Despite many years of study into inversions, very little is known about their functional consequences, especially in humans. A common hypothesis is that the selective value of inversions stems in part from their effects on nearby genes, although evidence of this in natural populations is almost nonexistent. Here we present a global analysis of a new 415-kb polymorphic inversion that is among the longest ones found in humans and is the first with clear position effects. This inversion is located in chromosome 19 and has been generated by non-homologous end joining between blocks of transposable elements with low identity. PCR genotyping in 541 individuals from eight different human populatio…
Hacia el Genoma de los Derechos Humanos
2000
El "genoma" laboral: orígenes, componentes y evolución del derecho del trabajo
2007
El presente trabajo ofrece una reflexión sobre el origen y la evolución del Derecho del Trabajo. El tema, tratado en numerosas ocasiones por la doctrina, se aborda desde una perspectiva distinta a la habitual. Así, siguiendo el ejemplo del profesor Romagnoli, se recurre a un símil consistente en plantear el análisis como un intento por reconstruir lo que podría denominarse �genoma� laboral. Ello lleva a abordar, en primer lugar, el �caldo de cultivo� en el que se gesta, es decir, el contexto histórico en el que aparece esta disciplina; en segundo lugar, sus �cromosomas�, es decir, los distintos componentes que la integran y modelan; finalmente, los �agentes mutágenos�, es decir, las circuns…
Visa genoma asociācija identificē ģenētiskos marķierus, kas saistīti ar hipofīzes adenomas risku un fenotipu
2019
Visa genoma asociācijas pētījumi(GWAS) ir pētījumu metode noteikta klīniskā stāvokļa ģenētiskā cēloņa noskaidrošanai, izmantojot genotipēšanas mikromasīvus un SNP nelīdzsvarotās saistības principu. Hipofīzes adenomas(HA) ir nemetastazējoši audzēji ar dažādu molekulāro izcelsmi. Līdz šim zināmas vairākas somatiskas mutācijas (GNAS, MEN1, USP8, GPR101), kas asociētas ar noteiktu HA klīnisko tipu klātbūtni, kā arī veikti kandidātgēnu pētījumi HA ģenētisko cēloņu noteikšanai. Līdz šim pasaulē veikts tikai viens GWAS pētījums, lai konstatētu ar HA tumoroģenēzi asociētos SNP Ķīnas Han populācijā. Šajā darbā izmantoja 233 HA un 468 kontroles indivīdu genotipus, tika noteikti ar palielinātu hipofīz…
Neolithic mitochondrial haplogroup H genomes and the genetic origins of Europeans
2013
Brotherton, Paul et al.-- The Genographic Consortium