Search results for "miRNS"
showing 9 items of 9 documents
Vaskulārā miRoma raksturojums un tā saistība ar koronāro artēriju slimību
2021
Koronāro artēriju slimības ir viens no vadošajiem mirstības cēloņiem daudzās pasaules valstīs. Lai gan genomā ir atrasti vairāki simti riska lokusi, liela daļa no tiem atrodas proteīnus nekodējošā genoma daļā, tāpēc ir grūti aprakstīt to funkcionālo nozīmi. Lai to risinātu, var izmantot milti-omikas pieejas, apvienojot datus no dažādiem molekulārās regulācijas līmeņiem. Šajā darbā tiek aprakstīta iekšējās mammārās artērijas miRNS kopa labi raksturotai pacientu kohortai, kam veikta koronāro artēriju šuntēšana ar nolūku šos datus apvienot ar genoma un proteoma analīzi šajos pašos audos. Tāpat tiek parādītas vairākas miRNS asociācijas ar zināmiem koronāro artēriju slimības riska faktoriem, apr…
Hipofīzes neiroendokrīno audzēju raksturīgo mikro RNS identificēšana un izpēte pacientu plazmā
2021
Cirkulējošās plazmas mikro RNS (miRNS) ir plaši pētīts biomarķieris ļaundabīgo audzēju diagnostikā, bet saistībā ar hipofīzes neiroendokrīnajiem audzējiem (PitNET) tās ir maz izpētītas. Darbā, izmantojot nākamās paaudzes sekvencēšanu, tika analizētas miRNS izmaiņas pacientu plazmas paraugos pirms un 24 stundas pēc ekstirpācijas, kā arī novērtēts miRNS saturs plazmā no pacienta, kuram tika veikta bilaterālā inferioro petrozālo sinusu katetrizācija (BIPSS). Pirms un pēc ekstirpācijas cirkulējošo miRNS sastāvs tika analizētas 34 pacientos un diferenciālekspresijas analīzē statistiski būtiskas izmaiņas (P < 0,05) 24 stundas pēc PitNET ekstirpācijas tika detektētas 22 miRNS, no kurām 15 bija aug…
Ābeļu (Malus domestica Borkh.) izturības pret kraupi (Venturia inaequalis (Cooke) Wint.) reakcijas nodrošināšanā iesaistīto miRNS raksturojums
2016
Dārza ābele ir viena no nozīmīgākajām augļkultūrām Eiropā un arī Latvijā. Kraupis, ko izraisa patogēnā sēne, nodara lielus zaudējumus ražai komerciālajos dārzos, tāpēc selekcijai tiek meklētas jaunas pazīmes, kas nodrošinātu izturību pret kraupi. Līdz šīm atklātie rezistences gēni pilnībā neizskaidro rezistences mehānismus, bet jaunākie pētījumi rāda, ka mikroRNS ir būtiska ietekme uz rezistenci. Darba mērķis ir identificēt un raksturot ābeļu rezistences reakcijā pret kraupja infekciju potenciāli iesaistītās miRNS. Kā galvenās metodes tika izmantotas mRNS un miRNS izdalīšana un qPCR reakcijas, un relatīvās ekspresijas noteikšana. Galvenie darba secinājumi ir tādi, ka izvēlētā miRLn11 nav ie…
Ārpusšūnu cirkulējošo nukleīnskābju izpēte hipofīzes adenomas pacientos
2019
Līdz šim literatūrā nav ziņojumu par ccfDNA un cirkulējošo miRNS izpēti HA pacientu plazmā. Darbā tika novērtēta iespējamība detektēt HA izcelsmes ccfDNA plazmā, veicot mērķētu NGS pozīcijās, kuras saturēja HA somatiskās mutācijas, un veikts pētījums par miRNS sastāva izmaiņu detektēšanu plazmā 24 stundas pēc HA rezekcijas. HA eksomos atklātās somatiskās mutācijas tikai detektētas septiņās no 16 pārbaudītajām pozīcijām ccfDNA amplikonos. Divās ccfDNA pozīcijās mutantā alēle bija vairāk nekā 2% no kopējā nolasījumu skaita, kas varētu liecināt par šo ccfDNA izcelsmi no HA. Piecās pozīcijās no diviem HA pacientiem mutantās alēles īpatsvars ccfDNA bija ap 50%, kaut gan šīs mutācijas netika kons…
Molekulārie mikroRNS faktori hipofīzes adenomas attīstībā
2021
Izmaiņas miRNS ekspresijā ir saistītas ar dažādu audzēju patoģenēzi, tāpēc tās ir iespējams izmantot kā biomarķierus. Lai pētītu, kādas miRNS ir saistītas ar hipofīzes adenomām (HA), darbā ar nākamās paaudzes sekvencēšanu (NGS) tika analizēts miRNS sastāvs 13 HA pacientu audos, kā arī analizēts cirkulējošo miRNS profils plazmā pirms un pēc HA rezekcijas operācijas 13 HA pacientos. Statistiski būtiskas (P < 0,05) miRNS sastāva izmaiņas asins plazmā 24 stundas pēc operācijas noteiktas piecām miRNS (hsa-miR-143-3p; hsa-miR-1290; hsa-miR-223-3p; hsa-miR-12136; hsa-miR-425-5p) un to izmaiņas pēc Log2 fold change bija robežās no 0,55 līdz 2,87. HA pacientu audos tika identificētas 70 statistiski …
Saimniekorganisma miRNS loma zarnu mikrobioma kompozīcijas izmaiņās diētas ar paaugstinātu tauku saturu ierosinātā 2. tipa cukura diabēta peļu modelī…
2021
Otrā tipa cukura diabēta ārstēšanai visplašāk izmantotais medikaments ir metformīns. Cilvēkiem, kas lieto metformīnu ir novērotas blakusparādības, kuru cēlonis, iespējams, ir saistīts ar zarnu mikrobioma izmaiņām. Lai noskaidrotu, vai fekālās miRNS korelē ar zarnu mikrobiomu, paraugi tika sekvenēti, izmantojot Small RNA-seq metodi. MiR-29 saimes pārstāvji pozitīvi korelēja ar Clostridia ģints baktērijām un negatīvi korelēja ar Bacteroides un Bacilli. Mmu-miR-30a-5p parādīja lielāko pozitīvo korelāciju ar Firmicutes un Proteus mirabilis, negatīvo – ar Bacteroides baktērijām. Netika novērotas metformīna ierosinātas miRNS izmaiņas. Atslēgas vārdi: otrā tipa cukura diabēts, metformīns, miRNS, z…
Sintētisko miRNS ietekme uz zarnu mikrobioma kompozīciju 2. tipa cukura diabēta peļu modelī
2022
Zarnu mikrobioma kompozīcijas izmaiņas tiek asociētas ar dažādām slimībām, tostarp otrā tipa cukura diabētu (T2D). Interese par T2D ārstēšanu, regulējot mikrobiomu, ir strauji augusi. Ir pierādīts, ka miRNS spēj tieši saistīties pie baktērijām, tādējādi ietekmējot to sastopamību. Lai noskaidrotu, vai un kā miRNS ietekmē mikrobioma sastāvu un diabēta izpausmes diētas ierosinātā T2D peļu modelī, tām tika orāli nodrošināta nedēļu ilga dažādu miRNS terapija, kam sekoja fēču metagenoma sekvencēšana. Pelēm, kas saņēma paaugstināta tauku satura barību, miRNS terapijas ietekmē izmainījās zarnu mikrobioma kompozīcija. Pēc miR-141-3p terapijas atšķirīgi sastopami bija Eggerthellaceae, Clostridiales, …
Hipofīzes adenomu ietekmējošo kandidātfaktoru funkcionālā raksturošana šūnu kultūrās
2022
Hipofīzes neiroendokrīnais audzējs (PitNET) ir labdabīgs smadzeņu audzējs, kas ir viens no visbiežāk sastopamajiem audzējiem smadzeņu dobumā. Molekulārie un šūnu mehānismi, kas veicina PitNET patoģenēzi, vēl nav labi izprasti. Somatostatīna receptoru analogi (SSA) tiek izmantoti audzēju ārstēšanai, tomēr daļai pacientu ir novērota rezistence pret SSA, kuru būtiski ietekmē dažādu gēnu ekspresija. Šajā darbā PitNET šūnu līnijās tika validēti un funkcionāli noraksturoti PitNET transkriptomu sekvencēšanā atklātie G-proteīna signalizācijas regulatora 4 (RGS4) un miR-625-5p kandidātfaktori un novērtēta SSA transkriptomiskā un funkcionālā ietekme uz somatotrofo GH3 šūnu līniju. Iegūtie rezultāti p…
Saimniekorganisma miRNS un zarnu mikrobioma mijiedarbība dažādos kolonoskopijas izmeklējumu paraugos
2022
Cilvēka gastrointestinālajā traktā ir daudzveidīgs mikrobioms, kam ir būtiska loma veselības uzturēšanā un fizioloģisko funkciju veikšanā organismā. Mikrobioma traucējumi ietekmē imūnsistēmas funkcijas, vielmaiņu, kā arī saistīti ar dažādām slimībām. MikroRNS (miRNS) ir nozīmīga loma gēnu ekspresijas regulēšanā. Pētījumos noskaidrots, ka saimniekorganisma miRNS tieši ietekmē zarnu mikrobiomu, tādējādi potenciāli nodrošinot daudzsološu stratēģiju, lai mērķtiecīgi modificētu mikrobiomu. Lai noskaidrotu, vai pacientu, kuriem dažādu iemeslu dēļ ir veikta kolonoskopija, zarnu biopsiju miRNS korelē ar fēču mikrobiomu veikta mazo RNS un metagenoma sekvencēšana. MiR200, miR-151, miR-30 saimes pozit…