Search results for "ekspresija"
showing 10 items of 22 documents
Smiltsērkšķu marafivīrusa kodēto proteīnu klonēšana, ekspresija un raksturošana
2022
Smiltsērķšu marafivīruss (SBuMV) ir iepriekš neraksturots, smiltsērkšķus inficējošs vīruss. Tam ir divas atklātās translācijas fāzes (ORF), kur ORF1 kodē poliproteīnu, kas satur četrus proteīnu domēnus, bet ORF2 kodē apvalka proteīnu (CP). Šajā darbā tika izveidotas ekspresijas plazmīdas SBuMV kodētajiem proteīniem, taču E. coli sistēmā izdevās ekspresēt un attīrīt tikai abas CP formas un proteāzes (PRO) domēnu. Tika pārbaudīta PRO aktivitāte, PRO šķelšanas saits un verificēta PRO deubikvitināzes (DUB) aktivitāte. SBuMV mažorais CP E. coli spēj pašsavākties vīrusam līdzīgajās daļinās (VLP), bet minorais CP veido agregātus. Koekspresijas rezultātā, ja abas CP formas ekspresē no vienas plazmī…
Ādas mezenhimālo cilmes šūnu fenotipa izvērtējums 2D un 3D šūnu kultūrās
2017
3D šūnu kultūras labāk atspoguļo šūnu mijiedarbību organismā, salīdzinājumā ar standarta 2D kultūrām. Šūnu fenotips 3D var mainīties un ietekmēt šūnu īpašības. Bakalaura darba mērķis bija raksturot mezenhimālo cilmes šūnu (MCŠ) fenotipu 2D un 3D šūnu kultūrās. 3D šūnu kultūra tika inducēta ar polyHEMA pārklājumu. Šūnu dzīvotspēja, MCŠ virsmas marķieri CD90, CD73, CD105, CD34, CD45, CD271 un pluripotences marķieri Oct4, SSEA-1, SSEA-4 tika analizēti 2D un 3D MCŠ kultūrā, izmantojot plūsmas citometrijas metodi. MCŠ dzīvotspēja 2D un 3D kultūrā būtiski neatšķīrās. CD90 ekspresija 3D kultūrā pēc 48h kultivēšanas samazinājās līdz 54%. 4% D6 MCŠ pēc 24h kultivēšanas 3D ekspresēja CD271. SSEA-4 ek…
Ar Lī sindromu saistīto mitohondriālās DNS variantu ietekme uz gēnu ekspresiju
2022
Lī sindroms ir reta iedzimta progresējoša neirodeģeneratīva mitohondriālā slimība, kas parasti sāk izpausties jau zīdaiņa vecumā vai agrā bērnībā. Lī sindromu var izraisīt izmaiņas gan kodola, gan mitohondriju genomā. Patogēni varianti mitohondriju genomā var ietekmēt kodola gēnu ekspresiju caur mitohondriju atgriezenisko regulāciju. Maģistra darba mērķis bija noskaidrot divu, ar Lī sindromu saistītu, mitohondriālās DNS (mtDNS) variantu ietekmi uz gēnu ekspresiju. Tika veikta transkriptoma analīze transmitohondriālo citoplazmatisko hibrīdu (cibrīdu) šūnu līnijām, kas saturēja divus ar Lī sindromu saistītus mtDNS variantus, pārbaudīta abu patogēno variantu heteroplazmijas stabilitāte, veikta…
Bakteriofāga Enc34 replikācijas moduļa proteīnu ekspresija, attīrīšana un raksturošana
2016
Darbā tika veikta bakteriofāga Enc34 replikācijas moduļa proteīnu sekvenču analīze un hipotētisko proteīnu ORF3, ORF4, ORF5 un ORF6 eksperimentāla izpēte ar mērķi identificēt to funkcijas. Pētījumu rezultātā praimāzei ORF1 tika atklāts iepriekš neidentificēts helikāzes domēns un ORF8 tika re-anotēts kā resolvāze. Rekombinanti producēts ORF4 bija nešķīstošs, savukārt ORF3 un ORF5 – šķīstoši, un to sekmīga attīrīšana ļauj darbu turpināt ar proteīnu kristalizāciju. ORF6 un delēcijas variantam ORF6Δ21 tika noteiktas kristālstruktūras, kuru analīze kopā ar in vitro eksperimentiem parādīja, ka ORF6 ir ssDNS saistošais proteīns (SSB). Pētījumā pirmoreiz tika atklāta SSB C-terminālā reģiona nozīme …
Vaskulārā miRoma raksturojums un tā saistība ar koronāro artēriju slimību
2021
Koronāro artēriju slimības ir viens no vadošajiem mirstības cēloņiem daudzās pasaules valstīs. Lai gan genomā ir atrasti vairāki simti riska lokusi, liela daļa no tiem atrodas proteīnus nekodējošā genoma daļā, tāpēc ir grūti aprakstīt to funkcionālo nozīmi. Lai to risinātu, var izmantot milti-omikas pieejas, apvienojot datus no dažādiem molekulārās regulācijas līmeņiem. Šajā darbā tiek aprakstīta iekšējās mammārās artērijas miRNS kopa labi raksturotai pacientu kohortai, kam veikta koronāro artēriju šuntēšana ar nolūku šos datus apvienot ar genoma un proteoma analīzi šajos pašos audos. Tāpat tiek parādītas vairākas miRNS asociācijas ar zināmiem koronāro artēriju slimības riska faktoriem, apr…
Hepatīta C vīrusa ARFP ekspresija Escherichia coli un īpašību raksturošana
2017
Ar C hepatīta vīrusu inficēto cilvēku skaits pasaulē ir apmēram 170 miljoni. Pret HCV nav vakcīnas, tāpēc tiek veikti pētījumi, kas saistīti ar tās izstrādi. Darba mērķis bija iegūt HCV alternatīvā nolasīšanas rāmja proteīnus divās plazmīdu sistēmās, un optimizēt ekspresijas un attīrīšanas apstākļus augstas kvalitātes proteīnu iegūšanai. Darbā tika izmantoti dažāda garuma un genotipa ARFP un divas klonēšanas un ekspresijas plazmīdas ar atšķirīgu 6xHistag iezīmes novietojumu. Pēc indukcijas ar IPTG apstākļu optimizācijas augstākā ARFP ekspresija E. coli BL21(DE3) šūnās tika iegūta, inducējot 4h pie + 37°C un 6h pie + 30°C ar 0,4 mM IPTG. Pēc ARFP attīrīšanas ar imobilizēto metālafīno hromato…
Kārļa Padega grafika kā iedvesmas avots vizuālās mākslas stundās 9.klasē
2018
Diplomdarba “Kārļa Padega grafika kā iedvesmas avots vizuālās mākslas stundās 9.klasē ” mērķis ir iepazīt un izpētīt Kārļa Padega grafiskos izteiksmes paņēmienus un to izmantošanas iespējas vizuālās mākslas stundās 9.klasē, radot ekspresīvu un izteiksmes līdzekļiem bagātu tušas zīmējumu. Diplomdarba uzdevumu ietvarā ir apzināta literatūra par latviešu mākslinieku Kārli Padegu, raksturota K. Padega grafiskā daiļrade un tušas tehnikas specifika. Uzdevumu kopas izveidei ir izvērtēta pedagoģiskā un psiholoģiskā literatūra, kas atbilstu pusaudžu vecumposma īpašībām. Uzdevumu kopas četri uzdevumi ir realizēti pedagoģiskajā izmēģinājumā no kura secināms, ka K. Padega grafiskā daiļrade spēj iedvesm…
Jaunvārdi Lato Lapsas publikācijās
2015
Maģistra darbā ar nosaukumu “Jaunvārdi Lato Lapsas publikācijās” tiek pētīti emocionāli ekspresīvie pazemināta stila jaunvārdi Lato Lapsas publikācijās. Šī darba mērķis ir atrast emocionāli ekspresīvus pazeminātā stila jaunvārdus Lato Lapsas publikācijās un noteikt, kādam pazemināta stila slānim tie pieder, autora motivāciju šo vārdu lietošanai, ietekmi uz lasītāju un nozīmi emocionāli ekspresīvo stilu veidošanā. Darbā apkopota informācija par publicistikas valodas stilu, preses valodu, jaunvārdiem, pazemināta stila leksiku un emocionālo ekspresiju. Darbā veikta emocionāli ekspresīvu pazemināta stila jaunvārdu analīze. Pētījuma metodes ir kvantitatīvā satura analīze un teksta interpretācija…
Jaukto procesu koeficientu novērtēšana
2019
Literatūrā bieži vien tiek izvirzīts pieņēmums par procesa asimptotisku neatkarību, bet gandrīz tikpat bieži šie pieņēmumi netiek pārbaudīti. Lai gan asimptotiskās neatkarības jeb jaukto procesu teorija ir attīstīta jau pagājušajā gadsimtā, praktiskas novērtēšanas iespējas ir rastas tikai pēdējā laikā, vienlaicīgi tas arvien ir aktīvi pētīts temats. Šajā darbā tiek apskatītas pieejamās metodes jaukto procesu teorētiskajai un praktiskajai koeficientu novērtēšanai. Šobrīd vienīgais praktiski aprēķināmais novērtējums ir ϕ jauktā procesa koeficientam, kam darbā vērsta īpaša uzmanība tā noderīgo īpašību dēļ – tas sniedz vērtīgus ieskatus citādi grūti analizējamajos gēnu ekspresijas datos. Darbā …
Hipofīzes neiroendokrīno audzēju raksturīgo mikro RNS identificēšana un izpēte pacientu plazmā
2021
Cirkulējošās plazmas mikro RNS (miRNS) ir plaši pētīts biomarķieris ļaundabīgo audzēju diagnostikā, bet saistībā ar hipofīzes neiroendokrīnajiem audzējiem (PitNET) tās ir maz izpētītas. Darbā, izmantojot nākamās paaudzes sekvencēšanu, tika analizētas miRNS izmaiņas pacientu plazmas paraugos pirms un 24 stundas pēc ekstirpācijas, kā arī novērtēts miRNS saturs plazmā no pacienta, kuram tika veikta bilaterālā inferioro petrozālo sinusu katetrizācija (BIPSS). Pirms un pēc ekstirpācijas cirkulējošo miRNS sastāvs tika analizētas 34 pacientos un diferenciālekspresijas analīzē statistiski būtiskas izmaiņas (P < 0,05) 24 stundas pēc PitNET ekstirpācijas tika detektētas 22 miRNS, no kurām 15 bija aug…