Search results for "DNS"
showing 10 items of 50 documents
Āra bērza Betula pendula Roth iekrāsotajā koksnē esošo mikroorganismu noteikšana un to iespējamā saistība ar fizioloģiskajiem un bioķīmiskajiem proce…
2015
Latvijā āra bērzs Betula pendula Roth ir ekonomiski nozīmīgākais lapu koks, kuram vizuāli defekti ir nevēlami, īpaši finiera ražošanā. Sarkanbrūnais iekrāsojums stumbrā ir visizplatītākais vizuālā defekta veids. Pētījuma mērķi bija turpināt apzināt un pielāgot metodes iekrāsojuma pētīšanai, cenšoties galveno uzsvaru likt uz molekulārajām metodēm, piemēram, mikroorganismu profilēšanu, kas ļāva iekrāsotā koksnē identificēt tādas sugas un ģintis kā Pholiota squarrosa, Pholiota multicingulata, Agrocybe rivulosa, Cadophora fastigiata, Helotiales sp., Phialophora sp., Trametes versicolor. Iekrāsojumu mēdz uzskatīt kā koksnes trupes sākuma stadiju, tomēr pētījuma laikā trupējuši stumbri dažāda vec…
1,4-dihidropiridīna AV-153-Na mijiedarbības ar DNS molekulu izvērtējums šūnas ietvaros
2016
AV-153-Na ir 1,4-DHP analogs ar antimutagēnām un DNS pasargājošām īpašībām, kas spēj mijiedarboties ar DNS molekulu caur interkalāciju. Maģistra darba mērķis bija izvērtēt AV-153-Na spēju iekļūt šūnā un vizualizēt tā iespējamo mijiedarbību ar DNS molekulu. Rezultāti parādīja, ka AV-153-Na spēj nokļūt šūnā. AV-153-Na flluorescence tika vizualizēta gan dzīvās, gan fiksētās šūnās. Fluorescence tika konstatēta gan šūnu citoplazmā, gan šūnu kodolos. Pētāmā 1,4-DHP mijiedarbība ar DNS halo netika vizualizēta, tomēr pēc apstrādes ar koncentrētu sāļu šķīdumu fluorecence saglabājas tikai šūnu kodolu apvalku rajonā. Apkopojot iegūtos rezultātus un jau publicētos datus secinām, ka AV-153-Na mijiedarbo…
Ar metformīna lietošanu asociētas izmaiņas cilvēka zarnu mikrobioma sastāvā un DNS metilēšanas profilos
2017
Metformīns ir pirmās izvēles medikaments 2. tipa cukura diabēta ārstēšanā. Tam raksturīga variabilitāte terapijas efektivitātē un biežas blaknes. Medikamenta iedarbību var ietekmēt tādi faktori kā mijiedarbība ar zarnu mikrobiomu un gēnu ekspresijas regulācija DNS metilēšanas līmenī. Maģistra darba mērķis bija noskaidrot, kādas izmaiņas metformīns ierosina cilvēka zarnu mikrobioma kompozīcijā un leikocītu metilēšanas profilā. Darbā tika veikta 16S rRNS amplikonu analīze 18 metformīna lietotāju fēču paraugos un DNS metilēšanas novērtēšana 12 indivīdiem. Metformīna ierosinātas izmaiņas gan zarnu mikrobiomā, gan metilēšanas profilā tika novērotas jau pirmo 24 stundu laikā, daļēji skaidrojot ie…
Patogēnas mtDNS mutācijas saturošu citoplazmatisko hibrīdu šūnu modeļu izveide un raksturošana
2020
Eikariotu šūnās ģenētisko materiālu DNS formā satur gan kodols, gan mitohondriji. Patogēnas mutācijas mitohondriālajā DNS (mtDNS) var izraisīt dažādas heterogēnas saslimšanas. Lai izpētītu, kā patogēnas mtDNS mutācijas ietekmē mitohondriju funkciju, var izmantot citoplazmatisko hibrīdu jeb cibrīdu šūnu modeļus. Bakalaura darba mērķis ir izveidot un raksturot patogēnas mtDNS mutācijas saturošus citoplazmatisko hibrīdu šūnu modeļus. Tika veikta pilna garuma mtDNS sekvenēšana, cibrīdu šūnu modeļu izveidošana, šūnu dzīvotspējas un OXPHOS enzīmu aktivitātes noteikšana. Pilna garuma mtDNS sekvenēšana tika veikta 20 pacientiem ar aizdomām par mitohondriālo saslimšanu. Trim pacientiem tika konstatē…
Monoklonālās antivielas - mūsdienu ārstēšanas iespējas
2018
Biozāles ir viens no straujāk augošajiem farmaceitiskās rūpniecības segmentiem veselības aprūpē. Rekombinantās DNS tehnoloģijas un hibridomu tehnoloģijas progress, ir izraisījis liela mēroga proteīnu ražošanu, kuriem ir potenciāli terapeitiski pielietojumi. Kopš 1975. gada, kad pirmo reizi ziņots par monoklonālo antivielu (moAv) attīstību, pagājuši vairāk kā 40 gadi un apmēram 100 terapeitiskās moAv ir apstiprinātas kā zāles, kuras galvenokārt pielieto onkoloģisku un autoimūnu slimību terapijā. Šī pētījuma mērķis bija apzināt ārstu zināšanas par moAv un, noskaidrot ārstu pieredzi un iespējas moAv terapijas pielietošanai Latvijā. Tika veikta aptauja, kurā piedalījās 67 respondenti. Pēc aptau…
Mitohondriālo slimību diagnostika, izmantojot molekulārās bioloģijas metodes un citoplazmatisko hibrīdu šūnu modeļus
2017
Mitohondriju galvenā funkcija ir enerģijas ražošana šūnā. Traucējumi mitohondriju elpošanas ķēdē var izraisīt plaša spektra patoloģijas. Patogēno mtDNS mutāciju ietekmi uz šūnu fenotipu iespējams pētīt citoplazmatisko hibrīdu šūnu līnijās. Darba mērķis ir analizēt citoplazmatisko hibrīdu šūnu modeļus un noteikt to piemērotību mitohondriālo slimību raksturošanai un diagnostikai. Tika veikta kontroles grupas un pacientu citoplazmatisko hibrīdu šūnu līniju mtDNS fragmentu sekvenēšana, mtDNS kopiju skaita, ATF koncentrācijas un elpošanas ķēdes kompleksu aktivitāšu noteikšana un salīdzināšana, kā arī tika raksturota izveidoto šūnu līniju stabilitāte. Lai apstiprinātu atbilstību donoru trombocītu…
MtDNS mutāciju, kas ir saistītas ar antibiotiķu inducētu nesindromisku kurlumu, noteikšana etnisku latviešu populācijā
2018
Šajā darbā ir aplūkota cilvēku mitohondriālā genoma 12S rRNS kodējošā gēna (MT-RNR1) polimorfismu izplatība etnisku latviešu populācijā. Vismaz sešas šī gēna mutācijas – A1555G, C1494T, T1095C, T961G, 961insC(n) un A827G – tiek asociētas ar paaugstinātu ototoksicitātes risku, lietojot aminoglikozīdu klases antibiotikas. Mutāciju noteikšanai 12S rRNS gēna fragmenti tika sekvenēti 191 etnisko latviešu mtDNS paraugam. Rezultātā 14 no tiem tika identificēta kāda no mitohondriālajām mutācijām, to skaitā četri patogēnie varianti, starp kuriem vienam tika konstatēta saistība ar mtDNS H11a haplogrupu, un divi jauni varianti, G951A un T961A, kuru loma ototoksicitātes patoģenēzē vēl ir neskaidra. Ieg…
Ar novecošanos saistītu biomarķieru un mtDNS mutāciju izpēte multirezistentās tuberkulozes pacientiem
2020
Darba mērķis: izmantojot biomarķierus, noteikt iespējamo multirezistentās tuberkulozes (MDR-TB) infekcijas saistību ar imūnsistēmas novecošanos un noskaidrot mtDNS variāciju lomu slimības gaitā un farmakoterapijā. Darbā ir analizētas mtDNS daudzuma un telomēru garuma izmaiņas, un apskatīta MDR-TB pacientu ieradumu un citu saistīto faktoru ietekme. MDR-TB pacientiem konstatēts paaugstināts mtDNS kopiju skaits un samazināts telomēru garums salīdzinājumā ar kontroles grupu. Būtiskās izmaiņas vērojamas tikai vīriešu grupā. Biomarķieru izmaiņas iespaidoja arī smēķēšana, terapijas ilgums un saņemto zāļu devu skaits. Identificētas vairākas mtDNS variācijas ar iespējamo ietekmi uz slimības procesie…
Personalizēta krūts vēža molekulārā diagnostikas testa izstrāde individuāli pielāgotai ārstniecības izvēlei un slimības gaitas novērošanai
2020
Šī darba mērķis ir izstrādāt krūts vēža molekulāro diagnostikas testu, kas balstās uz somatisko mutāciju noteikšanu audzēja audos un to izsekošanu asinīs slimīgas gaitā. Lai noteiktu somatiskās mutācijas, tika veikta 121 gēna mērķētā sekvencēšana audzēja audu un asins šūnu genomiskās DNS paraugos un izvērtēta atrasto mutāciju bioloģiskā nozīme. No pacientu asins paraugiem tika izolēta šūnu brīvā DNS (cfDNS) un ārpusšūnu vezikulas (EVs), un atlasītas mutācijas, ko paredzēts testēt šajos paraugos. Darba turpinājumā paredzēts salīdzināt divu veidu šķidro biopsiju testus – mutāciju kvantificēšanu cfDNS paraugos, izmantot pilienu digitālo PCR (ddPCR) un EV-iekļautās RNS sekvenēšanu.
Datu analīzes algoritma izstrāde šūnas kodolā internalizējošu aptamēru atlasei
2020
Aptamēri ir moderna zāļu ārstēšanās forma ar lielu potenciālu, kas iekļauj sevī gan jaunas diagnostikas iespējas, tā var tikt lietota kā zāļu forma kurai piemīt agonisma vai antagonisma farmakoloģiskās īpašības pret receptoriem, vai aptamēri var tikt izmantoti kā īpašs zāļu transports. Aptamēru iegūšanas un pētīšanas metodika ir ļoti daudzveidīga un vēl aizvien uzlabojama, jo tai ir daudz posmu, kurus ir iespējams modificēt un pielāgot izpētes vajadzībām, īpaši interesanta ir arī sekvenču datu apstrādes daļa, caur kuru no miljoniem sekvenču beigās, pēc aptamēriem nepieciešamām īpašībām – specifiskuma pret mērķi, saistīšanās spējas jeb afinitātes ar mērķi, oligonukleotīdu stabilitātes un cit…