Search results for "mikrobioms"
showing 10 items of 13 documents
Amoksicilīna un klaritromicīna kombinētās terapijas ilgtermiņa ietekme uz zarnu trakta mikrobiomu
2018
Helicobacter pylori ir viens no pirmajiem identificētajiem bakteriālajiem karcinogēniem un Eiropas medicīnas pārstāvju izstrādātās vadlīnijas iekļauj eradikācijas shēmu, kurā ietilpst kombinēta plaša spektra antibiotiku pielietošana. Antibakteriālā terapija, it īpaši plaša spektra antibiotiku pielietošana rada risku īstermiņa un ilgtermiņa zarnu trakta mikrobioma disbiozes attīstībai. Maģistra darba mērķis bija noskaidrot Helicobacter pylori kombinētās antibakteriālās terapijas izraisītās ilgtermiņa izmaiņas zarnu trakta mikrobiomā. Pētījuma gaitā tika veikta 45 pacientu 16s rRNS amplikonu analīze, salīdzinot pirms un pēc terapijas iegūtos fēču paraugus. Ilgtermiņa antibakteriālās terapijas…
16S rRNS gēna vairāku un divu mainīgo reģionu mikrobioma rekonstrukcijas algoritmu iegūto rezultātu salīdzināšana
2022
16S rRNS marķiergēna sekvencēšana ir viena no plašāk izmantotākajām un lētākajām mikrobioma taksonomiskā profila rekonstruēšanas metodēm. Taču, īso sekvencēšanas nolasījumu dēļ, visi gēna mainīgie reģioni nevar tikt nolasīti vienlaicīgi, bet tos nolasot atsevišķi zūd katra atsevišķā reģiona sasaiste ar pārējiem molekulas reģioniem kā arī par katru var tikt iegūts atšķirīgs datu apjoms, kas ierobežo kopējo mikrobioma kopas profilēšanas izšķirtspēju. Šajā darbā tiek aplūkota varbūtiskās rekonstrukcijas algoritma pieeja, kura izmanto vairāku 16S rRNS gēna reģionu noleases datus un maksimālās iespējamības varbūtisko algoritmu mikrobioma taksonomiskā profila rekonstrukcijai. Izmantojot Short MUl…
Sekretorā IgA un zarnu mikrobioma mijiedarbība un dinamika antidiabētiskās terapijas laikā
2022
Metformīns ir viens no visplašāk izmantotajiem medikamentiem 2.tipa cukura diabēta (T2D) ārstēšanā. Papildus glikozes izdales samazināšanai aknās un glikozes uzņemšanas palielināšanai muskuļos, arvien vairāk pierādījumu liecina, ka zarnu mikrobioms ir metformīna galvenā darbības vieta. Jaunākie pētījumi liecina, ka metformīns būtiski maina zarnu mikrobiomu T2D pacientiem. Sekretorajam IgA ir svarīga loma zarnu, elpceļu un uroģenitālās gļotādas epitēlija aizsardzībā un homeostatiskā regulēšanā, kā arī mijiedarbībā ar mikrobiomu. Metformīna terapijas laikā tika ievākti fēču paraugi no 19 jaundiagnosticētiem T2D pacientiem (trīs laika punktos) un astoņām veselām kontrolēm (divos laika punktos)…
Cilvēka zarnu mikrobioma salīdzinājums pacientiem ar dažādu 2.tipa cukura diabēta ilgumu un terapiju veidiem
2021
Maģistra darba izstrādes laikā iegūti rezultāti par zarnu mikrobioma taksonomiskā sastāva atšķirībām 270 pacientos ar 2. tipa cukura diabēta (T2D) diagnozi, bet atšķirīgu tā ilgumu kopš diagnosticēšanas brīža un pielietotajām antidiabētiskajām terapijām. Darba mērķis bija noskaidrot, kā šīm T2D pacientu apakšgrupām atšķiras zarnu mikrobioma taksonomiskais profils. Mikrobiālajai DNS, kas iegūta no fēču paraugiem, tika veikta visa metagenoma analīze ar lielapjoma paralēlo sekvenēšanu. Darba rezultāti apstiprināja vairākas zināmas asociācijas starp dažādām antidiabētiskajām terapijām un cilvēka zarnu mikrobiomu, kā arī iegūti jauni dati par zarnu mikrobioma taksonomiskajām atšķirībām indivīdos…
Cilvēka asins mikrobioma kompozīcijas, stabilitātes un izcelsmes noteikšana veselos indivīdos
2021
Neseni pētījumi ir apliecinājuši asins mikrobioma klātesamību veselos cilvēkos, tomēr tā izcelsme vēl ir neskaidra. Maģistra darba mērķis bija noskaidrot asins mikrobioma kompozīciju, potenciālo izcelsmi un dinamiku laika gaitā veseliem indivīdiem. Asins mikrobioma izcelsmes noskaidrošanai 10 veseliem indivīdiem ievāca pilnasins paraugus un ādas, maksts, mutes un fēču mikrobioma uztriepes. Pilnasins un fēču paraugus ievāca no diviem laika punktiem ar 3 mēnešu intervālu. Ar 16S rRNS gēna V3-V4 reģiona analīzi noteica to taksonomisko sastāvu. Noskaidrojās, ka asins mikrobioms ir unikāls - tajā izteikti dominē Proteobacteria tipa Pseudomonas ģints pārstāvji, un vienlaikus tā potenciālā izcelsm…
Augu ekstraktu un ēterisko eļļu saturošu augļu un dārzeņu tīrīšanas līdzekļu sastāva izstrāde
2021
Augļu un dārzeņu virsmas ir piesārņotas ar mikroorganismiem un pesticīdu atliekvielām. Mērķis bija izstrādāt augu ekstraktu un ēterisko eļļu saturošu augļu un dārzeņu tīrīšanas līdzekļa sastāvu. Tika noskaidrota 10 augu ekstraktu un 11 ēterisko eļļu antimikrobiālā aktivitāte. No 8 augļu un dārzeņu virsmu uzsējumiem tika iegūta aina par virsmu mikrobiomu. Tika izveidoti tīrīšanas līdzekļu sastāvi un pārbaudīta to antimikrobiālā aktivitāte, kā arī novērtēta spēja notīrīt gurķa virsmu. Starp visām pētāmajām komponentēm ugunspuķes un bērza ekstraktiem un kanēļa, piparmētras, citronzāles un 4 zagļu ēteriskajām eļļām piemita vislielākā antimikrobiālā aktivitāte. Uz augļu un dārzeņu virsmas sastop…
Ar metformīna lietošanu asociētas izmaiņas cilvēka zarnu mikrobioma sastāvā un DNS metilēšanas profilos
2017
Metformīns ir pirmās izvēles medikaments 2. tipa cukura diabēta ārstēšanā. Tam raksturīga variabilitāte terapijas efektivitātē un biežas blaknes. Medikamenta iedarbību var ietekmēt tādi faktori kā mijiedarbība ar zarnu mikrobiomu un gēnu ekspresijas regulācija DNS metilēšanas līmenī. Maģistra darba mērķis bija noskaidrot, kādas izmaiņas metformīns ierosina cilvēka zarnu mikrobioma kompozīcijā un leikocītu metilēšanas profilā. Darbā tika veikta 16S rRNS amplikonu analīze 18 metformīna lietotāju fēču paraugos un DNS metilēšanas novērtēšana 12 indivīdiem. Metformīna ierosinātas izmaiņas gan zarnu mikrobiomā, gan metilēšanas profilā tika novērotas jau pirmo 24 stundu laikā, daļēji skaidrojot ie…
Taksonomiskās izmaiņas zarnu mikrobioma sastāvā, lietojot metformīnu, pacientiem ar 2.tipa cukura diabētu
2018
Metformīns ir medikaments, kurš tiek plaši izmantots 2.tipa cukura diabēta (T2D) ārstēšanā un kura lietošanas laikā būtiski izmainās cilvēka zarnu mikrobioma baktēriju daudzveidība. Bakalaura darba mērķis bija raksturot ar metformīna īstermiņa terapiju asociētās taksonomiskās kompozīcijas izmaiņas zarnu mikrobiomā jaundiagnosticētiem T2D pacientiem. No 23 iesaistīto T2D pacientu fēču paraugiem tikai izdalīta mikrobiālā DNS, veikta mazās ribosomālās subvienības gēna (16S rRNS) V3 reģiona taksonomiskās kompozīcijas analīze ar lielapjoma paralēlo sekvenēšanu. Rezultātā novērota statistiski būtiskas atšķirības β-daudzveidībā un fenotipa specifiskas izmaiņu tendences baktēriju iekšējā daudzveidī…
Antidiabētiskā medikamenta metformīna lietošanas ietekme uz cilvēka zarnu mikrobiomu
2015
Metformīns ir plaši lietots medikaments 2. tipa cukura diabēta ārstēšanā. Pastāv hipotēze, ka metformīna ietekme uz organismu daļēji varētu tikt skaidrota ar tā mijiedarbību ar zarnu mikrobiomu. Bakalaura darba mērķis bija noskaidrot, kā metformīns ietekmē zarnu mikrobioma kompozīciju. Darba ietvaros tika izdalīta mikrobiālā DNS no astoņu cilvēku fēču paraugiem, kas bija ievākti dažādos laika posmos no metformīna lietošanas uzsākšanas, un, izmantojot lielapjoma paralēlo sekvenēšanu, veikta 16S rRNS V3 reģiona analīze, lai salīdzinātu mikrobioma kompozīciju. Pēc nedēļu ilgas metformīna lietošanas tika novērotas būtiskas izmaiņas vairāku taksonomisko vienību īpatsvarā un mikrobioma iekšējās d…
Antidiabētiskā medikamenta metformīna izraisītās funkcionālās izmaiņas cilvēka zarnu mikrobiomā
2018
Metformīns ir antidiabētisks medikaments, kas samazina glikozes līmeni asinīs un nerada hipoglikēmiju, tomēr ~25% pacientu attīstās gastrointestinālas blaknes. Ir veikti pētījumi par metformīna terapijas ietekmi uz 2. tipa cukura diabēta pacientu zarnu mikrobiomu, tomēr pilnīga metformīna un zarnu mikrobioma mijiedarbības raksturojuma joprojām nav. Darba mērķis bija noskaidrot, kā metformīns ietekmē vesela cilvēka zarnu mikrobioma taksonomisko un funkcionālo profilu. Mikrobiālajai DNS no fēču paraugiem tika veikta metagenoma analīze ar lielapjoma paralēlo sekvenēšanu. Rezultāti parāda vairākas izmaiņu tendences gan taksonomisko grupu, gan signālceļu un gēnu saimju īpatsvarā jau 24 stundas p…