Search results for "PROTEĪNS"
showing 10 items of 13 documents
Smiltsērkšķu marafivīrusa kodēto proteīnu klonēšana, ekspresija un raksturošana
2022
Smiltsērķšu marafivīruss (SBuMV) ir iepriekš neraksturots, smiltsērkšķus inficējošs vīruss. Tam ir divas atklātās translācijas fāzes (ORF), kur ORF1 kodē poliproteīnu, kas satur četrus proteīnu domēnus, bet ORF2 kodē apvalka proteīnu (CP). Šajā darbā tika izveidotas ekspresijas plazmīdas SBuMV kodētajiem proteīniem, taču E. coli sistēmā izdevās ekspresēt un attīrīt tikai abas CP formas un proteāzes (PRO) domēnu. Tika pārbaudīta PRO aktivitāte, PRO šķelšanas saits un verificēta PRO deubikvitināzes (DUB) aktivitāte. SBuMV mažorais CP E. coli spēj pašsavākties vīrusam līdzīgajās daļinās (VLP), bet minorais CP veido agregātus. Koekspresijas rezultātā, ja abas CP formas ekspresē no vienas plazmī…
No ssRNS bakteriofāgiem atvasināto vīrusveidīgo daļiņu platformas pielietojums Laimas slimības vakcīnas prototipa izstrādē
2021
ssRNS bakteriofāgu apvalka proteīnu veidotās vīrusveidīgās daļiņas tiek veiksmīgi izmantotas vakcīnu dizainā savu imunogēno īpašību un spējas prezentēt patogēnu epitopus. Bakalaura darbā tika pētīta trīs jaunu ssRNS bakteriofāgu apvalka proteīnu kovalento dimēru spēja pašsavākties imunogēnās himērās VLP. Jau iepriekš izveidoto apvalka proteīnu kovalento dimēru sekvenču N- vai C- galam ģenētiski pievienoja Laimas slimības izraisītājas Borrelia burgdorferi proteīna BB0689 sekvenci. Iegūtajiem sešiem konstruktiem tika pārbaudīta himērā proteīna producēšanās un šķīdība. Šķīstošus proteīnus attīrīja ar gelfiltrāciju. VLP izveidošanos pārbaudīja elektronu mikroskopā. Iegūtās VLP, kur antigēns pie…
Korelācija starp aknu steatozi un lipīdu frakcijām asins analīzēs
2016
Ievads. Tauku hepatoze ir atgriezenisks process un relatīvi bieža atradne ar riska faktoriem kā aptaukošanās, dislipidēmija, cukura diabēts, glikozes tolerances traucējumi. Viena no visnozīmīgākajām analīzēm riska faktoru izvērtēšanai ir lipīdu frakcijas serumā. Aknu steatoze var izzust bez sekām vai progresēt par aknu fibrozi, aknu cirozi un hepatocelulāro karcinomu. Darba mērķis. Izpētīt aknu steatozes un lipīdu frakciju iespējamu korelāciju. Materiāli un metodes. Tika veikts retrospektīvs pētījums, kura ietvaros atlasīja pacientus ar radioloģiski apstiprinātu aknu steatozes diagnozi stacionēšanas laikā PSKUS laika periodā no 01.01.2014.-31.12.2015. Par aknu blīvumu pie tauku hepatozes ti…
Tetrazīna fragmentu saturošu linkeru sintēze proteīnu modificēšanai
2022
Maģistra darbā ir veikta jaunu, alifātisku un PEG fragmentus saturošu, tetrazīna linkeru sintēze proteīnu biokonjugācijai. Darba ietvaros iegūti un izolēti 3 linkeri, kas paredzēti neselektīvai Lys aminoskābju atlikumu modificēšanai, un arī iegūti vēl 3 linkeri, kas paredzēti reģiospecifiskai proteīna N-gala modificēšanai. Darba ietvaros arī izolēts viens linkeris, kas paredzēts His modificēšanai. Visi sintezētie linkeri tika testēti modificējot Borrelia Burgdorferi MlpC lipoproteīnu, kā arī veikta paraugu MALDI-TOF MS analīze, kurā no septiņiem linkeriem, seši ir uzrādījuši konjugāta veidošanos ar MlpC.
Sakarība starp PTH un IGFBP-1 līmeņiem un to ietekme uz gados vecāku sieviešu mirstību 10 gadu prospektīvā pēcpārbaudes pētījumā
2016
KOPSAVILKUMS Atslēgas vārdi: Paratiroīdais hormons, Insulīnam Līdzīgā Augšanas Faktora Saistošais Proteīns-1, Kardiovaskulārās Slimības, Mirstība. Ievads: Šī pētījuma mērķis bija definēt un pētīt tiešu un netiešu mijiedarbību starp faktoriem, kas ietekmē kalcija homeostāzes sistēmu un metabolā sindroma attīstību. Mēs analizējām iespējamās korelācijas starp PTH un IGFBP-1 un dažiem metabolā sindroma marķieriem, tad pielietojām Koksa regresijas analīzi, lai izpētīt kopējo PTH un IGFBP-1 ietekmi uz mirstību kardiovaskulāro slimību dēļ, kuriem ir zināma saikne ar metabolo sindromu. Materiāli un metodes: Šis ir longitudināls, uz populāciju balstīts prospektīvs kohortas pētījums ar 10 gadu ilgu p…
Bakteriofāga AP205 apvalka proteīna strukturālie pētījumi
2015
Darbā ar rentgenstruktūranalīzes palīdzību tika noteikta Acinetobacter fāga AP205 apvalka proteīna struktūra 1,9 Å izšķirtspējā. Proteīna vispārējā struktūra ir līdzīga radniecīgo bakteriofāgu iepriekš noteiktajām struktūrām, bet ir vērojamas vairākas būtiskas atšķirības, no kurām nozīmīgākā ir C- un N- galu atrašanās uz kapsīdas virsmas. Iegūtie rezultāti izskaidro AP205 fāga kapsīdu toleranci pret garām insercijām C- un N- galos, kā arī paver ceļu racionālai apvalka proteīna modificēšanai praktiskiem pielietojumiem. Darbs izstrādāts Latvijas Biomedicīnas pētījumu un studiju centra proteīnu kristalogrāfijas laboratorijā Dr. biol. Kaspara Tāra vadībā.
Neirotrofo faktoru ekspresija streptozocīna - Alcheimera slimības modelī ar muscimolu
2016
1906. gadā vācu psihiatrs un neiropatologs Aloīzs Alcheimers pirmo reizi aprakstīja 56 gadu vecumā mirušu pacienti, kura mira neskaidras slimības dēļ, pēdējo četru gadu laikā strauji zaudējot atmiņu un dažādas iemaņas. Laika gaitā, analizējot medicīniskos pierakstus un pētot mirušās pacientes smadzenes, tika noteikta amiloīdo plātņu un neirofibrilāro mezglu esamība smadzenēs, kas tika nosaukta par Alcheimera slimību (Engstrom, 2007). Alcheimera slimība ir progresējoši smadzeņu darbības traucējumi, kā rezultātā smadzenes pakāpeniski „noārdās”. Visbiežāk tā rodas cilvēkiem 65-70 gadu vecumā. Slimības attīstības gaitā attīstās negatīvas izmaiņas atmiņā, domāšanā, dažādās darbībās un uzvedībā, …
Augu vīrusu strukturālo proteīnu domēni antigēnu multimerizācijai
2018
Maģistra darba mērķis ir pārbaudīt ekspresēto un attīrīto ApMV un CMV CP N-gala sajūgtos domēnus ar eGFP un PADRE T-šūnu epitopu oligomerizācijas īpašības un imunogenitāti peļu modelī, salīdzinot datus ar veselas vīrusveidīgās daļiņas imunogenitāti, ko varētu izmantot turpmākiem eksperimentiem imunoloģiski nozīmīga epitopa pārbaudē. Maģistra darbs tika izstrādāts no 2016. gada septembra līdz 2018. gada maijam Augu virusoloģijas grupā Latvijas Biomedicīnas pētījumu un studiju centrā, Dr. biol. Andra Zeltiņa un Dr. biol. Inas Baļķes vadībā. Darba gaitā, papildus bakalaura darba ietvaros izveidotām konstrukcijām, tika izveidotas vēl divas konstrukcijas, kur CP N-terminālie domēni, papildus eGF…
FRET fluorescento proteīnu balstītu pH sensoru izveide
2018
Iekššūnas vides pH ir būtisks parametrs, kas raksturo šūnā notiekošos procesus, kā arī šūnas vitalitāti. Fluorescento proteīnu pielietošana pH noteikšanai ir daudzsološa metode. Pieejami atšķirīgas pH jutības fluorescentie proteīni, tie neuzrāda augstu toksicitāti un invazivitāti, padarot tos piemērotus dzīvu šūnu pētījumiem. Maģistra darba mērķis bija izveidot fluorescento proteīnu saturošus konstruktus ar atšķirīgu pH jutības slieksni, izmantojot Aquamarine, ECFP, EYFP un Citrine fluorescentos proteīnus, kas darbosies kā pH sensoru sistēma dzīvās šūnās, izmantojot FRET metodi. Trīs konstrukciju izveide (pAqua-HL3-Citrine, pAqua-HL3-EYFP, pECFP-HL3-EYFP) veikta ar dažādām metodiskajām piee…
Melanokortīna otrā tipa receptora un tā palīgproteīna ekspresija rauga Pichia Pastoris ekspresijas sistēmā
2015
Darba ietvaros tika izveidots pPIC9K- MC2R-T4L ekspresijas konstrukts, kas tika ekspresēts P.Pastoris sistēmā. Western blot analīze uzrādīja nepieciešamās molekulmasas zonu. MC2R-T4L izdevās attīrīt uz His- un Ha-tag afinitātes kolonnām. Lai noteiktu funkcionāla MC2R struktūru, to nepiecieciešams ekspresēt kompleksā ar MRAP, tādēļ tika izveidoti vairāki MC2-MRAP konstrukti, ko tālāk izmantot proteīna ekspresijai P. Pastoris šūnās. To aktivitāte tika pārbaudīta zīdītāju šūnu līnijās nosakot cAMP daudzuma izmaiņas pēc stimulācijas ar ACTH (1-24). Iegūtie rezultāti bija nestabili, tādēļ tālākajos pētījumos tiks veikta radioaktīvā ACTH saistīšanas mērījumus. Darbs tika veikts no 2013.gada jūnij…